典型文献
黄秆乌哺鸡竹转录组EST-SSR分子标记开发与应用
文献摘要：
基于黄秆乌哺鸡竹(Phyllostachys vivax McClure f.aureocaulis N.X.Ma)转录组数据,利用生物信息学方法分析其SSR位点分布特征,同时针对"黄秆"和"绿秆"两种类型差异表达基因序列中的SSR位点设计引物,并利用刚竹属(Phyllostachys)材料验证其通用性.结果显示,从黄秆乌哺鸡竹89 874个Unigenes序列中,共鉴定出12 651个SSR位点,分布频率为14.07％;其中单核苷酸重复基序最多(51.02％)、其次为3核苷酸(25.61％)和2核苷酸(21.94％);共发现80种重复基序,其中出现频率最高的为A/T(46.60％),其次是AG/CT(13.97％)和CCG/CGG(9.90％).在设计的51对引物中,44对(86.27％)能有效扩增,在刚竹属材料中平均通用性为92.41％,其中39对具有多态性,多态性EST-SSR标记能区分同属的不同种,但不能有效区分种内种质资源.
文献关键词：
黄秆乌哺鸡竹;转录组;EST-SSR标记;通用性
中图分类号：
作者姓名：
娄永峰;甘然;朱成磊;肖复明;高志民
作者机构：
江西省林业科学院,江西省植物生物技术重点实验室,南昌330032;国际竹藤中心,国家林业和草原局/北京市竹藤科学与技术重点开放实验室,北京100102
文献出处：
引用格式：
[1]娄永峰;甘然;朱成磊;肖复明;高志民-.黄秆乌哺鸡竹转录组EST-SSR分子标记开发与应用)[J].植物科学学报,2022(03):355-364
A类：
黄秆乌哺鸡竹,aureocaulis
B类：
EST,SSR,分子标记开发,开发与应用,Phyllostachys,vivax,McClure,Ma,转录组数据,利用生物,生物信息学方法,时针,类型差异,差异表达基因,基因序列,引物,刚竹属,通用性,Unigenes,分布频率,单核苷酸,基序,AG,CCG,CGG,中平,多态性,同属,分种,种内,种质资源
AB值：
0.385915
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