典型文献
妃子笑荔枝LcSAI启动子的克隆及其生物信息学分析
文献摘要：
[目的]酸性转化酶在荔枝糖代谢中具有重要作用,克隆和分析荔枝酸性转化酶基因(LcSAI)启动子,以期为LcSAI调控荔枝糖代谢的功能研究提供理论依据.[方法]以妃子笑荔枝果肉为材料,根据荔枝基因组序列信息,克隆LcSAI上游约1500bp的启动子序列,并利用生物信息学工具对启动子序列中的转录起始位点、顺式作用元件及CpG岛进行预测分析.[结果]克隆得到1514 bp的LcSAI启动子序列,启动子顺式作用元件除了存在大量的启动子核心元件如TATA-box和增强元件CAAT-box外,还存在光响应顺式元件、激素应答元件、厌氧诱导响应元件、MYB结合位点、MYC结合位点及一些未知功能的顺式作用元件.LcSAI启动子序列可能存在3处核心启动子区域,LcSAI启动子区没有预测到符合限定条件的CpG岛.[结论]LcSAI基因启动子与逆境胁迫有关,推测酸性转化酶在荔枝抵御逆境胁迫的生理过程中具有重要作用.
文献关键词：
妃子笑荔枝;酸性转化酶基因;启动子;克隆;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
董晨;李金枝;郑雪文;王弋;李伟才
作者机构：
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业农村部热带果树生物学重点实验室,广东湛江524091
文献出处：
引用格式：
[1]董晨;李金枝;郑雪文;王弋;李伟才-.妃子笑荔枝LcSAI启动子的克隆及其生物信息学分析)[J].广东农业科学,2022(03):25-30
A类：
LcSAI,酸性转化酶基因,1500bp
B类：
妃子笑荔枝,生物信息学分析,糖代谢,功能研究,荔枝果,果肉,基因组序列,序列信息,启动子序列,利用生物,生物信息学工具,转录起始位点,顺式作用元件,CpG,预测分析,子核,TATA,box,CAAT,光响应,激素应答,厌氧,氧诱导,响应元,MYB,结合位点,MYC,核心启动子,启动子区域,限定条件,基因启动子,逆境胁迫,生理过程
AB值：
0.228595
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