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2020-2021年冬季长春市水痘-带状疱疹病毒流行株基因特征分析
文献摘要：
目的 分析2020-2021年冬季长春市水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)流行株的基因特征.方法 选择48例2020-2021年长春市水痘或带状疱疹患者为研究对象,制备疱疹液样本.提取VZV的DNA,以其为模板PCR扩增VZV基因组ORF22、ORF38、ORF54及ORF62特异性片段,并测序.将测序结果与各基因型VZV代表株的ORF22单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行比对;应用SnapGene软件寻找测序结果中ORF38-Pst Ⅰ、ORF54-Bgl Ⅰ和ORF62-Sma Ⅰ酶切位点,并与Oka株(Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+)进行比对.结果 48份疱疹液样本VZV基因ORF22-SNP位点碱基均与pOka株一致,为Clade2基因型.其中47份为Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+,1份为Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+,均为野毒株.结论 2020-2021年冬季长春市流行的VZV均为Clade2基因型的野毒株,且具有高度保守性.
文献关键词：
水痘-带状疱疹病毒;基因型;开放阅读框;单核苷酸多态性
中图分类号：
作者姓名：
付兴烨;李晴;吕品;姜雪鸥;孟迪;张夫坤
作者机构：
长春祈健生物制品有限责任公司,吉林长春130000;吉林大学动物科学学院,吉林长春130062
文献出处：
引用格式：
[1]付兴烨;李晴;吕品;姜雪鸥;孟迪;张夫坤-.2020-2021年冬季长春市水痘-带状疱疹病毒流行株基因特征分析)[J].中国生物制品学杂志,2022(04):424-426,432
A类：
ORF54,Bgl,+Sma,pOka,Clade2
B类：
长春市,水痘,带状疱疹病毒,基因特征分析,varicella,zoster,virus,VZV,年长,带状疱疹患者,ORF22,ORF38,ORF62,基因型,代表株,单核苷酸多态性,single,nucleotide,polymorphism,SNP,SnapGene,Pst,酶切位点,碱基,野毒株,保守性,开放阅读框
AB值：
0.234043
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