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染色质免疫共沉淀测序技术研究进展
文献摘要：
染色质免疫共沉淀测序(chromatin immunoprecipitation followed by sequencing,ChIP-seq)是研究目的蛋白与 DNA相互作用的重要方法,被广泛应用于转录因子、组蛋白修饰等分布与功能的研究.研究人员通过对细胞分离、染色质片段化以及测序文库构建等关键步骤不断优化,使ChIP-seq适合少量细胞的分析.近年来发展迅速的CUT&RUN(cleavage under targets and release using nuclease)、CUT&Tag(cleavage under targets and tagmentation)技术,利用特异性抗体使酶"靶向"结合目标蛋白,通过MNase酶切或Tn5转座酶切割染色质,简化了实验操作流程.本文介绍了 ChIP-seq的原理及其数据分析方法,比较ChIP-seq优化方法和衍生技术.总结了在植物生长发育过程中,转录因子和组蛋白修饰在生物钟调控、激素信号转导、光信号途径、胁迫响应等方面研究与染色质免疫共沉淀测序技术的应用.
文献关键词：
染色质免疫共沉淀;转录因子;组蛋白修饰;数据分析
中图分类号：
作者姓名：
陈桂芳;杨佳怡;高运华;任歌
作者机构：
中国计量科学研究院,北京100029;沈阳化工大学,沈阳110142
文献出处：
引用格式：
[1]陈桂芳;杨佳怡;高运华;任歌-.染色质免疫共沉淀测序技术研究进展)[J].生物技术通报,2022(07):40-50
A类：
染色质免疫共沉淀测序技术
B类：
chromatin,immunoprecipitation,followed,by,sequencing,ChIP,研究目的,目的蛋白,组蛋白修饰,细胞分离,片段化,序文,文库构建,关键步骤,CUT,RUN,cleavage,under,targets,release,using,nuclease,Tag,tagmentation,特异性抗体,MNase,Tn5,转座酶,实验操作,操作流程,数据分析方法,植物生长发育,生物钟,激素信号,信号转导,光信号途径,胁迫响应
AB值：
0.368384
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