典型文献
大白菜花茎蜡粉近等基因系转录组分析
文献摘要:
为研究大白菜花茎蜡粉分子调控机制,针对大白菜一对花茎蜡粉差异的近等基因系进行了转录组比较分析.在有蜡粉材料RHL0651和无蜡粉材料RHL0652之间总共鉴定到7237个基因存在显著差异表达,主要富集在碳水化合物生物过程、原生质膜的组成成分和四吡咯结合分子功能.结合基因功能注释,筛选到17个蜡粉相关基因,包括蜡粉合成基因MAH1、CYTB5-B (Bra022898,Bra021809)、KCS6/CER6/CUT1、KCS9、FAR3/CER4、KCS1、CER2、KCD/PAS2、CYTB5-C (Bra039268,Bra004518)、CER2-LIKE,蜡粉转运基因LTPG1 (Bra010912,Bra030067)和转录因子基因WIN1/SHINE1、MYB30、DEWAX在两自交系间存在显著差异表达,其可能参与了大白菜花茎表皮蜡粉形成.利用qRT-PCR验证了转录组分析的可靠性以及差异表达基因在不同组织的表达模式.研究结果有助于进一步克隆大白菜蜡粉调控基因和开发相关功能分子标记.
文献关键词:
大白菜;蜡粉;转录组;候选基因
中图分类号:
作者姓名:
王荣花;王树彬;刘栓桃;李巧云;张志刚;王立华;赵智中
作者机构:
山东省农业科学院蔬菜花卉研究所,国家蔬菜改良中心山东分中心,山东省设施蔬菜生物学重点实验室,农业农村部黄淮地区蔬菜科学观测实验站(山东),济南250100
文献出处:
引用格式:
[1]王荣花;王树彬;刘栓桃;李巧云;张志刚;王立华;赵智中-.大白菜花茎蜡粉近等基因系转录组分析)[J].园艺学报,2022(01):62-72
A类:
RHL0651,RHL0652,MAH1,CYTB5,Bra022898,Bra021809,KCS6,CER6,CUT1,KCS9,FAR3,CER4,KCS1,CER2,KCD,PAS2,Bra039268,Bra004518,LTPG1,Bra010912,Bra030067,WIN1,SHINE1,DEWAX,表皮蜡粉
B类:
大白菜,白菜花,花茎,近等基因系,转录组分析,分子调控机制,总共,碳水化合物,生物过程,原生质,质膜,组成成分,吡咯,基因功能注释,LIKE,转运基因,MYB30,自交系,qRT,差异表达基因,不同组织,表达模式,调控基因,相关功能,分子标记,候选基因
AB值:
0.175768
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