典型文献
金黄色葡萄球菌噬菌体vB_Sau_P68的基因组分析和裂解酶
文献摘要：
[背景]金黄色葡萄球菌是常见的人畜共患条件致病菌,随着多耐药菌株分离率的增长,研发与抗生素作用模式不同的抗菌剂迫在眉睫.[目的]分离高效且特异性强的金黄色葡萄球菌噬菌体,对其进行功能注释,并对其编码的裂解酶进行功能验证.[方法]通过对噬菌体全基因组序列进行分析找到裂解酶基因,利用原核表达系统对其编码的2个裂解酶蛋白进行克隆,用SDS-PAGE与蛋白免疫印迹法(Western blotting)鉴定目的蛋白是否表达,并采用单斑法验证其裂解活性.[结果]本研究的噬菌体为一株新的金黄色葡萄球菌噬菌体,命名为vB_Sau_P68,该基因组全长为139 409 bp,GC含量为31.0％,编码220个开放阅读框(open reading frame,ORF),透射电镜观察具有正二十面体头部和收缩性尾部,形态学分类属于肌尾噬菌体.该噬菌体编码2个裂解酶基因,分别具有CHAP催化结构域与SH3_5结合结构域,SDS-PAGE与Western blotting表明Lys161能够表达且有裂解活性,Lys163则无法外源表达.对Lys161序列进行分析,该裂解酶无信号肽,无跨膜区域,以无规则卷曲为主.[结论]本研究对一株新的金黄色葡萄球菌噬菌体编码的2个裂解酶基因进行了克隆表达,结果提示CHAP催化结构域具有裂解活性,而SH3_5结合结构域则不表达.这一结果可为裂解酶的机制探索及应用提供理论基础.
文献关键词：
全基因组分析;CHAP结构域;SH3_5结构域;蛋白结构
中图分类号：
作者姓名：
于诗筠;吕金晖;文会淇;张雅倩;喻鑫婷;米志强;黄海龙
作者机构：
吉林农业大学动物科学技术学院,吉林长春130118;军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室,北京100071;安徽医科大学解放军307临床学院,北京100071
文献出处：
引用格式：
[1]于诗筠;吕金晖;文会淇;张雅倩;喻鑫婷;米志强;黄海龙-.金黄色葡萄球菌噬菌体vB_Sau_P68的基因组分析和裂解酶)[J].微生物学通报,2022(08):3107-3119
A类：
Lys161,Lys163
B类：
金黄色葡萄球菌,噬菌体,vB,Sau,P68,裂解酶,人畜共患,条件致病菌,多耐药,耐药菌株,菌株分离,分离率,作用模式,抗菌剂,功能注释,功能验证,体全,全基因组序列,酶基因,原核表达,表达系统,SDS,PAGE,蛋白免疫印迹法,blotting,目的蛋白,裂解活性,一株,基因组全长,bp,开放阅读框,open,reading,frame,ORF,透射电镜,电镜观察,二十面体,收缩性,尾部,形态学分类,类属,别具,CHAP,催化结构域,SH3,结合结构,外源表达,信号肽,无规则,卷曲,克隆表达,机制探索,全基因组分析,蛋白结构
AB值：
0.323231
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