典型文献
新型淡水微囊藻噬藻体vB_MweS-yong2的分离与基因组分析
文献摘要:
[目的 ]蓝藻(cyanobacteria)水华频繁暴发,引起水质恶化,使水生生物大量死亡,给水产养殖业造成巨大的经济损失;其代谢产物藻毒素具有肝毒性、神经毒性、生殖毒性、遗传毒性和肿瘤促进作用,并可在水生生物中富集,造成饮用水安全风险和水产品食用安全风险.噬藻体(cyanophages)是一类特异性侵染蓝藻的病毒,参与调控蓝藻的种群密度和丰度,被认为是极具潜力的蓝藻水华生物防控工具.以往的研究报道多集中于海水噬藻体,有关淡水噬藻体的报道寥寥无几,迄今尚无惠氏微囊藻(Microcystis vvesenbergii)噬藻体的研究报道.本研究的目的在于分离、鉴定惠氏微囊藻噬藻体.[方法]以惠氏微囊藻FACHB-1112为指示宿主,采用双层平板法从淡水中分离出噬藻体vB_MweS-yong2,对其进行全基因组测序、基因功能注释和系统进化分析.[结果]vB_MweS-yong2的基因组长44 530bp,G+C含量为71.6%,有61个开放阅读框(ORF)、1 个 tRNA基因.成对序列比较(pairwise sequence comparison,PASC)表明,vB_MweS-yong2与所有已知噬菌体间的全基因组核苷酸序列相似度最高只有20.21%,小于<50%的属边界值.没有在vB_MweS-yong2基因组中发现抗生素耐药基因和毒力因子基因,显示该噬藻体在基因水平上的安全性.[结论]vB_MweS-yong2在有尾目的长尾科中代表一个新的属.本研究丰富了淡水噬藻体库、基因库,并为以后研发该噬藻体的功能基因、进一步研发用于治理以惠氏微囊藻为优势种引起的水华的产品与技术奠定了基础.
文献关键词:
惠氏微囊藻;噬藻体;基因组;系统进化分析
中图分类号:
作者姓名:
王飞;潘灵婷;钱敏桦;蔡汝倩;林威;洪斌鑫;杨佳豪;李靓;李登峰;童贻刚
作者机构:
宁波大学海洋学院,浙江宁波315000;北京化工大学生命科学与技术学院,北京100029
文献出处:
引用格式:
[1]王飞;潘灵婷;钱敏桦;蔡汝倩;林威;洪斌鑫;杨佳豪;李靓;李登峰;童贻刚-.新型淡水微囊藻噬藻体vB_MweS-yong2的分离与基因组分析)[J].微生物学报,2022(10):3784-3800
A类:
噬藻体,MweS,yong2,cyanophages,惠氏微囊藻,vvesenbergii,530bp
B类:
淡水,vB,基因组分析,cyanobacteria,水质恶化,水生生物,给水,水产养殖业,代谢产物,藻毒素,肝毒性,神经毒性,生殖毒性,遗传毒性,中富,饮用水安全,水安全风险,水产品,食用安全,侵染,种群密度,蓝藻水华,生物防控,多集,寥寥无几,Microcystis,FACHB,宿主,双层平板,全基因组测序,基因功能注释,系统进化分析,组长,G+C,开放阅读框,ORF,tRNA,序列比较,pairwise,sequence,comparison,PASC,噬菌体,边界值,抗生素耐药基因,毒力因子,基因水平,长尾,中代,基因库,功能基因,优势种
AB值:
0.270683
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