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典型文献
SCN2A和 ABCB1与 CYP2C19*3单核苷酸多态性与抑郁症遗传易感性的关联分析
文献摘要:
目的:遗传因素可增加抑郁症的发病风险,本研究通过分析13个候选基因与抑郁症的关联,探讨中国汉族人群抑郁症的遗传风险因子。方法:采用病例对照研究。选择2020年2月至2021年9月在广州医科大学附属脑科医院情感障碍科、成人精神科和老年科住院的439例抑郁症患者作为病例组,男性158例、女性281例,年龄为(29.84±14.91)岁;464名体检健康者作为对照组,男性196名、女性268名,年龄为(30.65±12.63)岁。应用基质辅助激光解吸电离飞行时间(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight,MALDI-TOF)质谱仪分析所有受检对象的13个候选基因20个位点。性别比较采用Pearson卡方检验,年龄和基因型分布的比较采用独立样本 t检验。采用PLINK软件中“哈迪-温伯格”和“等位基因频率”程序用于分析哈迪-温伯格平衡与基因频率,采用PLINK软件中“标准病例/对照关联测试”、“Max(T)置换”和“Bonferroni多次测试校正”程序用于分析基因与疾病的关联。 结果:PLINK分析显示,Bonferroni校正前 SCN2A rs17183814、 ABCB1 rs1045642与 CYP2C19*3 rs4986893、 NAT2*5A rs1799929与抑郁症有关联(χ 2=10.340, P=0.001;χ 2=11.010, P=0.001;χ 2=9.781, P=0.002;χ 2=4.481, P=0.034)。以上位点在对照组中的较小等位基因频率分别为12.07%、43.64%、2.59%和3.88%;病例组中较小等位基因频率分别为17.43%、35.99%、5.47%和6.04%;比值比(odds ratio, OR)分别为1.538、0.726、2.178和1.592。采用Max(T)置换程序经1 000 000次置换测试后上述4个位点的差异仍有统计学意义,经验 P值(EMP1)分别为0.002、0.001、0.003和0.042。Bonferroni校正后,只有 SCN2A rs17183814、 ABCB1 rs1045642与 CYP2C19*3 rs4986893位点的差异有统计学意义,校正后 P值分别为0.026、0.018和0.035。 结论:SCN2A rs17183814、 ABCB1 rs1045642与 CYP2C19*3 rs4986893位点与抑郁症易感性有关,其中 SCN2A rs17183814与 CYP2C19*3 rs4986893的A等位基因可能是中国汉族人群抑郁症的危险因素,而 ABCB1 rs1045642的T等位基因可能为中国汉族人群抑郁症的保护因素。
文献关键词:
抑郁症;等位基因;风险因子;遗传学;易感性
作者姓名:
张婷;饶庆敏;何咏茵;蔡金泰;刘海英;林裕龙
作者机构:
广州医科大学附属脑科医院检验科,广州 510370
引用格式:
[1]张婷;饶庆敏;何咏茵;蔡金泰;刘海英;林裕龙-.SCN2A和 ABCB1与 CYP2C19*3单核苷酸多态性与抑郁症遗传易感性的关联分析 )[J].中华预防医学杂志,2022(03):287-294
A类:
rs17183814,rs1799929,置换程序
B类:
SCN2A,ABCB1,CYP2C19,单核苷酸多态性,遗传易感性,感性的关联,遗传因素,发病风险,候选基因,中国汉族人群,风险因子,病例对照研究,广州医科大学,脑科,情感障碍,人精,精神科,老年科,抑郁症患者,健康者,基质辅助激光解吸电离,飞行时间,Matrix,Assisted,Laser,Desorption,Ionization,Time,Flight,MALDI,TOF,质谱仪,受检,个位,性别比,卡方检验,基因型分布,PLINK,哈迪,温伯格,等位基因频率,联测,Max,Bonferroni,次测试,正前,rs1045642,rs4986893,NAT2,5A,上位,比值比,odds,ratio,EMP1,保护因素,遗传学
AB值:
0.303907
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