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中国乙型肝炎病毒基因组序列突变及进化分析
文献摘要：
目的:了解中国乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）基因组序列的免疫逃逸突变、耐药突变和基因组进化信息。方法:选取1998-2021年在GenBank中的中国HBV全基因组序列信息作为分析对象，采用MAFFT软件进行聚类分析，使用在线工具Gen2pheno进行免疫逃逸突变和耐药突变分析，使用BEAST 1.10.4做序列的时间进化分析。结果:5 426条序列纳入分析集，分布于我国19个省份，C型占比最高（59.1%，3 211/5 426）。其次为B型（33.7%，1 833/5 426）。有764条（14.1%，764/5 426）序列发生了免疫逃逸突变，98.1%的序列至少发生了1处反转录酶编码区域突变。中国大部分系列的进化根在公元1801年左右。结论:中国HBV耐药突变率较高，HBV基因组进化缓慢。
文献关键词：
乙型肝炎;基因组耐药和免疫逃逸突变;基因组进化
中图分类号：
作者姓名：
郭永豪;豆巧华;刘倩;杨建辉;吕宛玉;丰达星;僧明华;张延炀;赵东阳
作者机构：
河南省疾病预防控制中心免疫预防医学重点实验室，郑州 450016
文献出处：
引用格式：
[1]郭永豪;豆巧华;刘倩;杨建辉;吕宛玉;丰达星;僧明华;张延炀;赵东阳-.中国乙型肝炎病毒基因组序列突变及进化分析)[J].中华流行病学杂志,2022(08):1309-1314
A类：
Gen2pheno,基因组耐药和免疫逃逸突变
B类：
乙型肝炎病毒,病毒基因组,进化分析,hepatitis,virus,HBV,耐药突变,基因组进化,GenBank,全基因组序列,序列信息,MAFFT,突变分析,BEAST,反转录酶,编码区,公元,突变率
AB值：
0.257351
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