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典型文献
基于MSAP技术的不同栽培生产区域宁夏枸杞DNA甲基化多态性分析
文献摘要:
宁夏枸杞在我国不同栽培产区环境中,发生了明显的表观遗传变异和分化.为探讨我国不同栽培产区宁夏枸杞DNA甲基化水平和模式的差异及变化规律,该文利用荧光标记辅助的甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术,对我国主要栽培产区宁夏银川平原、内蒙古巴彦淖尔、甘肃靖远、甘肃玉门、青海德令哈、新疆精河的53份宁夏枸杞基因组DNA样品进行甲基化水平和多态性分析.该研究建立了适用于宁夏枸杞基因组甲基化分析的MSAP技术体系,共筛选出10对MSAP选择性扩增引物,在所有共扩增出的5'-CCGG-3'甲基化位点中,35.85%为全甲基化位点、39.88%为半甲基化位点,表现出丰富的表观遗传分化程度.化学计量分析显示,影响宁夏枸杞表观遗传特性的主要因素是生态环境因素,其次是栽培品种差异因素,降水量、气温、土壤酸碱度等是影响各产地DNA甲基化差异的主要生态因子.该研究有助于深入理解宁夏枸杞在不同生态环境的适应策略,为枸杞子的种质溯源和道地性评判提供新的研究思路与方法.
文献关键词:
宁夏枸杞;DNA甲基化;甲基化敏感扩增多态性;表观遗传;生态因子
作者姓名:
张芳;卢有媛;尚尔鑫;郭盛;鲁学军;任钢;陈占平;赵玉玲;钱大玮;段金廒
作者机构:
南京中医药大学药学院江苏省中药资源产业化过程协同创新中心/中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心,江苏南京210023;宁夏医科大学药学院教育部回族医药现代化重点实验室,宁夏银川750021;宁夏枸杞创新中心,宁夏银川750002;青海省海西蒙古族藏族自治州农业科学研究所,青海德令哈817000;新疆维吾尔自治区博尔塔拉蒙古自治州精河县枸杞产业发展中心,新疆博尔塔拉833399
文献出处:
引用格式:
[1]张芳;卢有媛;尚尔鑫;郭盛;鲁学军;任钢;陈占平;赵玉玲;钱大玮;段金廒-.基于MSAP技术的不同栽培生产区域宁夏枸杞DNA甲基化多态性分析)[J].中国中药杂志,2022(02):392-402
A类:
CCGG,半甲基化
B类:
MSAP,生产区域,宁夏枸杞,多态性分析,表观遗传变异,甲基化水平,荧光标记,甲基化敏感扩增多态性,methylation,sensitive,amplified,polymorphism,银川平原,古巴,巴彦淖尔,甘肃靖远,甘肃玉门,海德,德令哈,精河,甲基化分析,扩增引物,甲基化位点,点中,遗传分化,分化程度,化学计量分析,遗传特性,栽培品种,品种差异,降水量,土壤酸碱度,生态因子,不同生态环境,适应策略,枸杞子,道地性,研究思路与方法
AB值:
0.295099
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