典型文献
石磺来源海洋链霉菌Streptomyces ardesiacus SCSIO LO23中germicidin类化合物的分离鉴定及其生物合成分析
文献摘要：
海洋共附生放线菌具有生产结构特殊和活性显著化合物的潜力.[目的]以海洋软体动物石磺Onchidium sp.来源共附生海洋链霉菌Streptomyces ardesiacus SCSIO LO23为研究对象,分离并鉴定其次级代谢产物结构,分析化合物的生物合成基因簇及其生物合成途径.[方法]采用多种培养基对该菌株进行发酵优化并放大发酵,利用多种柱色谱方法分离得到germicidin类化合物,并利用波谱学手段和X-Ray单晶衍射技术完成化合物的结构鉴定;利用Illumina HiSeq对目标菌株进行全基因组测序,结合antiSMASH和BLAST在线分析软件实现菌株中germicidin类化合物生物合成基因功能注释和生物合成途径分析,并通过异源表达进一步确定其生物合成基因.[结果]从AM3培养基发酵产物中分离鉴定了 6个吡喃酮类化合物germicidin A(1)、germicidin B(2)、germicidin D(3)、germicidin H(4)、isogermicidin A(5)和 isogermicidin B(6),其中化合物 2 和 6对斑马鱼神经行为有显著兴奋作用.通过对Illumina HiSeq测序结果生物信息学分析,结合异源表达,验证了化合物生物合成的相关基因,并结合文献对化合物1-6的生物合成途径进行了推导.[结论]本研究阐明了菌株S.ardesiacus SCSIO LO23来源germicidin类化合物的结构、生物活性和其生物合成基因,夯实了该类化合物的研究基础.
文献关键词：
germicidin;生物合成;Ⅲ型聚酮合酶;Streptomyces ardesiacus;海洋共附生放线菌
中图分类号：
作者姓名：
吴巧灵;孙长利;周镇槟;乔伊君;苗宗余;蔡磊;鞠建华
作者机构：
中国科学院南海海洋研究所,中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室,广东省海洋药物重点实验室,广东广州510301;中国科学院大学,北京100039;南方海洋科学与工程广东省实验室,广东广州511458;广东省实验动物监测所,广东省实验动物重点实验室,广东广州510663
文献出处：
引用格式：
[1]吴巧灵;孙长利;周镇槟;乔伊君;苗宗余;蔡磊;鞠建华-.石磺来源海洋链霉菌Streptomyces ardesiacus SCSIO LO23中germicidin类化合物的分离鉴定及其生物合成分析)[J].微生物学报,2022(07):2594-2609
A类：
ardesiacus,LO23,germicidin,海洋共附生放线菌,isogermicidin
B类：
链霉菌,Streptomyces,SCSIO,分离鉴定,合成分析,生产结构,软体动物,Onchidium,sp,次级代谢产物,分析化,生物合成基因簇,生物合成途径,发酵优化,谱方法,波谱学,Ray,单晶衍射,结构鉴定,Illumina,HiSeq,目标菌,全基因组测序,antiSMASH,BLAST,在线分析,软件实现,基因功能注释,途径分析,异源表达,AM3,发酵产物,吡喃酮,酮类化合物,斑马鱼,神经行为,兴奋,生物信息学分析,聚酮合酶
AB值：
0.241103
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
