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典型文献
登革病毒、黄热病毒和基孔肯雅病毒三重实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及评价
文献摘要:
目的:建立登革病毒(dengue virus, DENV)、黄热病毒(yellow fever virus, YFV)和基孔肯雅病毒(chikungunya virus, CHIKV)核酸的三重实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)检测方法。方法:通过全球共享数据库下载DENV(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型)、YFV、CHIKV全基因组序列进行比对分析,针对这3种病毒的相对保守区域分别设计特异性引物和探针,建立三重实时荧光定量RT-PCR检测方法,以其他病毒核酸评价方法的特异性,用病毒体外转录RNA评价方法的灵敏度,以病毒高、中、低浓度核酸进行独立重复实验评价方法的重复性。DENV采用登革热患者血清进行验证,YFV、CHIKV采用模拟阳性标本进行验证,采用健康人血清进行阴性验证。结果:本方法与其他病毒核酸无交叉反应;对DENV(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型)、YFV、CHIKV的最低检出限分别为21.55拷贝/反应、21.25拷贝/反应、21.85拷贝/反应、22.75拷贝/反应、22拷贝/反应、45.65拷贝/反应;各浓度检测 Ct值的标准差在0.5以内、变异系数在3%以下;临床阳性标本及模拟阳性标本的检出率为100%,健康人血清的阴性率为100%。 结论:本研究建立的DENV、YFV和CHIKV的三重实时荧光定量RT-PCR检测方法具有良好的特异性、灵敏度和重复性。
文献关键词:
逆转录-聚合酶链反应;登革病毒;黄热病毒;基孔肯雅病毒
作者姓名:
阚乃鹏;翁育伟;俞婷婷;王金章
作者机构:
福建省疾病预防控制中心,福州 350012;福建师范大学生命科学学院,福州 350108
引用格式:
[1]阚乃鹏;翁育伟;俞婷婷;王金章-.登革病毒、黄热病毒和基孔肯雅病毒三重实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及评价)[J].中华实验和临床病毒学杂志,2022(06):707-711
A类:
B类:
登革病毒,黄热病毒,基孔肯雅病毒,dengue,virus,DENV,yellow,fever,YFV,chikungunya,CHIKV,逆转录,聚合酶链反应,reverse,transcription,polymerase,chain,reaction,共享数据库,下载,全基因组序列,比对分析,特异性引物,立三,病毒核酸,病毒体,体外转录,实验评价,登革热,阳性标本,健康人,人血清,交叉反应,低检出限,拷贝,浓度检测,Ct,阴性率
AB值:
0.282614
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