典型文献
醋栗番茄染色体水平基因组组装
文献摘要：
利用HiFi长片段测序技术对醋栗番茄PI365967的基因组进行测序和从头组装,共构建了 924个连续的重叠群序列,N50长度高达12.8 Mb,获得了 PI365967染色体水平长度为834 M的高质量基因组序列.与栽培番茄Heinz1706基因组进行比较分析发现,二者存在倒位、缺失等大量结构变异.GO富集分析揭示了发生结构变异的基因可能的生物学功能.
文献关键词：
醋栗番茄;三代测序;基因组组装;结构变异
中图分类号：
作者姓名：
刘志强;蔡和序;崔霞
作者机构：
中国农业科学院蔬菜花卉研究所,农业农村部园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京100081;中国农业大学园艺学院,北京100193
文献出处：
引用格式：
[1]刘志强;蔡和序;崔霞-.醋栗番茄染色体水平基因组组装)[J].园艺学报,2022(10):2263-2272
A类：
醋栗番茄,PI365967,Heinz1706
B类：
基因组组装,HiFi,长片,从头组装,重叠群,N50,Mb,基因组序列,倒位,结构变异,富集分析,生物学功能,三代测序
AB值：
0.272195
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