典型文献
基于基因组结构变异构建萝卜种质资源分子身份证
文献摘要:
萝卜种质资源类型多样,难以通过表型评价判定其亲缘关系.本试验整合4份萝卜全基因组重测序数据和520份萝卜简化基因组测序数据进行生物信息学分析,鉴定了萝卜群体基因组水平的结构变异,开发了24个通用性的分子标记.使用上述标记对255份萝卜种质进行基因分型,构建了相应的萝卜分子身份证.聚类分析结果表明,在相关系数0.55处可将255份萝卜种质分为4个类群.基于基因组水平的大片段插入/缺失开发分子标记,具有通用性高、成本低、检测方便等优点,可以促进萝卜的种质纯度鉴定及分子育种工作.
文献关键词:
萝卜;结构变异;重测序;分子身份证;种质资源
中图分类号:
作者姓名:
严承欢;崔磊;任志勇;黄燕;矫振彪;朱凤娟;张振兴;甘彩霞;邓晓辉;邱正明
作者机构:
湖北省农业科学院经济作物研究所,蔬菜种质创新与遗传改良湖北省重点实验室,湖北武汉 430064;华中农业大学园艺林学学院,湖北武汉 430070
文献出处:
引用格式:
[1]严承欢;崔磊;任志勇;黄燕;矫振彪;朱凤娟;张振兴;甘彩霞;邓晓辉;邱正明-.基于基因组结构变异构建萝卜种质资源分子身份证)[J].中国蔬菜,2022(01):49-57
A类:
卜群体
B类:
基因组结构变异,萝卜,种质资源,分子身份证,资源类型,表型评价,评价判定,亲缘关系,全基因组重测序,序数,简化基因组测序,生物信息学分析,通用性,分子标记,基因分型,类群,大片,纯度鉴定,分子育种,育种工作
AB值:
0.280481
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