典型文献
香樟及近缘种的亲缘关系分析
文献摘要:
基于全基因组重测序技术开发的SNP标记,对香樟及近缘种的亲缘关系进行分析,结果表明,通过对16个香樟无性系和2个近缘种进行重测序分析,共获得209 Gb原始数据,平均有效测序深度16×.共获得约209308831个高质量SNP,纯合SNP共165814908个,杂合SNP共43493923个.由系统进化树可知11份芳樟无性系聚在一起,3份芳樟无性系与油樟聚在一起,然后与龙脑樟聚在一起,沉水樟和肉桂先被分离出来;通过主成分分析将16份香樟无性系分为3类,分别为芳樟类群、龙脑樟和油樟类群;芳樟、龙脑樟和油樟精油成分存在差异,为不同的化学利用类型.
文献关键词:
香樟;SNP标记;亲缘关系
中图分类号:
作者姓名:
向双;孙维红;万晓会;丁乐;韩国勇;邹双全;邹小兴
作者机构:
福建农林大学林学院,福建 福州350002;福建省林业调查规划院,福建 福州350001;福州植物园,福建 福州350000
文献出处:
引用格式:
[1]向双;孙维红;万晓会;丁乐;韩国勇;邹双全;邹小兴-.香樟及近缘种的亲缘关系分析)[J].福建农林大学学报(自然科学版),2022(02):204-209
A类:
油樟精油
B类:
香樟,近缘种,亲缘关系分析,全基因组重测序,技术开发,SNP,无性系,测序分析,共获,Gb,原始数据,杂合,系统进化树,芳樟,聚在一起,龙脑樟,沉水樟,肉桂,分离出来,类群,精油成分,化学利用,利用类型
AB值:
0.285949
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