典型文献
枣树阶段转变相关microRNA家族的鉴定及其表达分析
文献摘要：
与其他果树相比,枣树具有童期短、成花快的特征.已有研究表明,多个microRNA(miRNA)家族参与植物阶段转变和开花时间调控等过程.研究枣树阶段转变相关的miRNA家族对果树童期调控具有重要意义.以枣实生后代植株不同发育阶段(节位)的当年生枝(枣吊)为材料,通过Small RNA测序,在童期、过渡期和成年期等3个时期鉴定出27个miRNA家族的58个已知miRNA和23个新miRNA,其中44个差异表达的miRNA包括32个己知miRNA和12个新miRNA;然后,从中筛选出不同时期显著差异表达的6个miRNA,即zjmiR156a-5p、zjmiR 156j、zjmiR172c、zjmiR172e-3p、zjmiRnovel-16和zjmiRnovel-71,通过TargetFinder软件预测出它们的15个关键靶基因,其主要参与成花、转录调控和生物合成等过程;利用实时荧光定量PCR分析验证了12个miRNA及15个关键靶基因确实在枣树阶段转变中差异表达,并存在正调控或负调控关系,其中2个新miRNA(zjmiRnovel-16和zjmiRnovel-71)可能分别通过光周期和糖代谢途径影响阶段转变.
文献关键词：
枣;阶段转变;microRNA;靶基因;Small RNA测序
中图分类号：
作者姓名：
李莹;孟宪巍;马志航;刘孟军;赵锦
作者机构：
河北农业大学中国枣研究中心,河北保定071000;河北农业大学园艺学院,河北保定071000;河北农业大学生命科学学院,河北保定071000
文献出处：
引用格式：
[1]李莹;孟宪巍;马志航;刘孟军;赵锦-.枣树阶段转变相关microRNA家族的鉴定及其表达分析)[J].园艺学报,2022(01):23-40
A类：
zjmiR156a,zjmiR,156j,zjmiR172c,zjmiR172e,zjmiRnovel
B类：
枣树,阶段转变,变相,microRNA,表达分析,果树,童期,成花,miRNA,家族参与,开花时间,实生后代,植株,发育阶段,节位,枣吊,Small,过渡期,成年期,差异表达,5p,3p,TargetFinder,软件预测,预测出,关键靶基因,转录调控,生物合成,分析验证,正调控,负调控,光周期,糖代谢途径
AB值：
0.322528
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