典型文献
橡胶树树皮miRNA定量表达分析的内参筛选
文献摘要：
世界所需天然橡胶主要来自橡胶树,橡胶树的乳管是合成和储存天然橡胶的组织,树干树皮中的次生乳管与天然橡胶生产密切相关,由维管形成层分化而来.次生乳管数量与天然橡胶产量呈显著正相关.因此,乳管分化是天然橡胶生产面临的一个重大理论课题.植物miRNAs是一类长约20～24个核苷酸的非编码小RNA分子,通过介导基因沉默在植物生长发育、细胞分化及逆境适应中起着非常重要的调节作用.橡胶树乳管分化过程中差异miRNAs的鉴定对于进一步认识乳管分化的分子机理具有重要的作用.实时荧光定量PCR(qPCR)已广泛用于miRNA的定量表达分析,选择合适的miRNA内参对于准确进行miRNA的表达定量至关重要.本研究以冠菌素(coronatine,COR)诱导橡胶树萌条分化次生乳管的实验系统,采用小RNA Poly A加尾的qPCR技术分析COR处理对形成层区3个非编码RNA(U6 snRNA、5S rRNA、18S rRNA)和6个miRNA(hbr-miR159b、hbr-miR396b、miR169-x、miR172-y、miR535-x、miR894-x)候选内参的表达稳定性的影响.geNorm和NormFinder软件的联合分析结果显示,表达稳定性最高的是hbr-miR396b和miR894-x,稳定性较差的是U6 snRNA.hbr-miR396b和miR894-x可作为合适的内参基因,用于分析COR影响下的miRNA相对定量表达,为鉴定橡胶树次生乳管分化相关的差异表达miRNAs奠定良好基础.
文献关键词：
橡胶树;乳管分化;miRNA;冠菌素;内参基因
中图分类号：
作者姓名：
吴绍华;张世鑫;杨署光;田维敏
作者机构：
中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南海口 571101
文献出处：
引用格式：
[1]吴绍华;张世鑫;杨署光;田维敏-.橡胶树树皮miRNA定量表达分析的内参筛选)[J].热带作物学报,2022(11):2181-2187
A类：
由维管,乳管分化,冠菌素,coronatine,hbr,miR159b,miR396b,miR535,miR894,相对定量表达,次生乳管分化
B类：
橡胶树,树皮,表达分析,天然橡胶,树干,维管形成层,大理论,miRNAs,非编码,基因沉默,植物生长发育,细胞分化,逆境适应,分子机理,qPCR,表达定量,COR,树萌,实验系统,Poly,加尾,U6,snRNA,5S,rRNA,18S,miR169,miR172,表达稳定性,geNorm,NormFinder,联合分析,内参基因,差异表达,良好基础
AB值：
0.23378
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