典型文献
基于肠道宏基因组对弹涂鱼两栖适应性的研究
文献摘要：
[目的]从基因组水平上报道两种有代表性的两栖鱼类大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris,BP)和大鳍弹涂鱼(Periophthalmus magnuspinnatus,PM)对陆地生活的适应性,以揭示胃肠道微生物群对弹涂鱼在陆地生活的适应性及其特殊免疫力具有关键作用.[方法]采用16S扩增子测序和宏基因组技术,利用两种有代表性的弹涂鱼和3种典型水生鱼类(草鱼Ctenopharyngodon idellus、鲢鱼Hypophthalmichthys molitrix和鳙鱼Aristichthys nobilis)的宏基因组数据,比较两栖鱼类和水生鱼类肠道的微生物组成、多样性、丰度和功能,并研究潜在陆生标志微生物群.此外,通过查阅大量文献得到具有代表性的海水鱼类、淡水鱼类、两栖动物和陆生动物的胃肠道微生物群数据,比较弹涂鱼的肠道菌群组成和功能.[结果]在弹涂鱼的胃肠道微生物群中,厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门和梭杆菌门占主导地位.这些菌的含量在大鳍弹涂鱼、大弹涂鱼和水生鱼类之间存在显著差异.草鲢鳙和弹涂鱼二者胃肠道微生物群之间最大的区别是CKC4门(一种推测与宿主脂质代谢相关的胃肠道细菌门类)的比例,草鲢鳙中该比例从4％～27％不等,而在弹涂鱼中则没有发现.此外,弹涂鱼的胃肠道微生物群中同时具有陆生动物、淡水和海水鱼类以及两栖动物的典型细菌家族,这与它们在水陆过渡咸淡水交界处的生活特征相吻合.与陆生动物相比,鱼类拥有更高比例的梭状杆菌和变形杆菌,而陆生动物则具有更多的拟杆菌.在大弹涂鱼和大鳍弹涂鱼中还发现了此前被认为仅存在于陆生动物的S24-7菌株.[结论]推测弹涂鱼胃肠道微生物群落相比水生性鱼类具有复合和多样性特征,可以通过病原体相关分子模式PAMP刺激宿主在进化中形成多样性更高、拷贝数更多的天然免疫受体基因家族,以此适应更为复杂的两栖生活环境.
文献关键词：
胃肠道微生物群;宏基因组学;两栖弹涂鱼;陆地适应;免疫学特异性
中图分类号：
作者姓名：
董博;邓涵逸;孙艺秋;房元杰;彭淼曦;石琼;贝锦龙;魏文康;陈庄
作者机构：
广东省农业科学院农业生物基因研究中心/广东省农作物种质资源保存与利用重点实验室,广东广州 510640;深圳市海洋生物基因组 学重点实验室,广东深圳 518083;深圳大学生命科学与海洋学院,广东 深圳 518061
文献出处：
引用格式：
[1]董博;邓涵逸;孙艺秋;房元杰;彭淼曦;石琼;贝锦龙;魏文康;陈庄-.基于肠道宏基因组对弹涂鱼两栖适应性的研究)[J].广东农业科学,2022(11):32-42
A类：
Periophthalmus,magnuspinnatus,CKC4,两栖弹涂鱼,陆地适应,免疫学特异性
B类：
上报,大弹涂鱼,Boleophthalmus,pectinirostris,PM,胃肠道微生物群,免疫力,16S,扩增子测序,草鱼,Ctenopharyngodon,idellus,鲢鱼,Hypophthalmichthys,molitrix,鳙鱼,Aristichthys,nobilis,基因组数据,微生物组成,大量文,海水鱼类,淡水鱼类,两栖动物,陆生动物,肠道菌群组成,厚壁菌门,变形菌门,拟杆菌门,梭杆菌,鲢鳙,宿主,脂质代谢,肠道细菌,门类,有发现,水陆,咸淡水,交界处,相吻合,高比例,变形杆菌,此前,仅存,S24,肠道微生物群落,多样性特征,病原体相关分子模式,PAMP,拷贝数,天然免疫,基因家族,生活环境,宏基因组学
AB值：
0.224928
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