典型文献
无色杆菌77的基因组构成及其趋化和耐药特性
文献摘要：
无色杆菌77(Achromobacter sp.77)是黄瓜枯萎病菌(Fusarium oxysporum f.sp.cucumerinum,Foc)菌丝际优势细菌,可随Foc菌丝迁移且状态活跃.为明确菌株77在Foc菌丝际的定殖机理,本研究在分析菌株77全基因组构成基础上,研究了其趋化特性和耐药性.Illumina Hiseq+PacBio测序分析表明,菌株77基因组全长5868070 bp,仅含1条染色体,GC含量为65.89％.在KEGG、COG和GO数据库分别注释到2696、4862和4212个基因.菌株77基因组中含mcp、che、mot等重要趋化基因;通过CARD数据库注释,发现含有drr、emr等抗生素耐药外排泵基因、抗生素耐药基因簇以及多种抗生素的抗性基因.抗生素敏感性实验表明,菌株77对浓度低于300μg/mL的氯霉素、卡那霉素、氨苄青霉素以及浓度低于50μg/mL的四环素均有抗性,是一株多重耐药菌株.采用改良的游动平板法测定菌株77的趋化特性,结果表明,菌株77对1 mmol/L对羟基苯乙酸、水杨酸、α-酮戊二酸、延胡索酸、琥珀酸、苹果酸等多种根分泌物和真菌分泌物组分具有明显的趋化响应;0.5 mmol/L的上述化合物和0.5-1 mmol/L的镰刀菌酸可促进菌株77的生长.上述研究结果说明菌株77对根分泌物或真菌分泌物具有趋化和利用能力,是连作条件下无色杆菌属细菌在枯萎病菌菌丝际丰度升高的重要原因.
文献关键词：
无色杆菌;黄瓜枯萎病菌;全基因组分析;趋化;耐药
中图分类号：
作者姓名：
李霁虹;荆玉玲;马桂珍;郭荣君;李世东
作者机构：
江苏海洋大学环境与化学工程学院,连云港 222005;中国农业科学院植物保护研究所,北京 100193
文献出处：
引用格式：
[1]李霁虹;荆玉玲;马桂珍;郭荣君;李世东-.无色杆菌77的基因组构成及其趋化和耐药特性)[J].生物技术通报,2022(09):136-146
A类：
Hiseq+PacBio,mcp,mot,drr,emr
B类：
无色杆菌,组构,趋化,耐药特性,Achromobacter,黄瓜枯萎病菌,Fusarium,oxysporum,cucumerinum,Foc,菌丝,可随,定殖,构成基础,耐药性,Illumina,测序分析,基因组全长,bp,COG,che,CARD,外排泵基因,抗生素耐药基因,基因簇,抗性基因,抗生素敏感性,氯霉素,卡那霉素,氨苄青霉素,四环素,一株,多重耐药菌,耐药菌株,游动,苯乙酸,水杨酸,延胡索酸,琥珀酸,苹果酸,分泌物,镰刀菌,连作,杆菌属,全基因组分析
AB值：
0.316003
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