典型文献
基于生物信息学数据分析ELTD1在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基化水平及其临床意义
文献摘要：
目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水平及其与患者临床病理特征和预后的相关性.方法:通过公共数据库分析ccRCC组织中ELTD1表达和甲基化的差异水平,探讨ELTD1表达水平与患者临床病理特征和预后的相关性.通过TIMER2.0数据库评估ccRCC免疫细胞浸润,筛选ELTD1相关免疫检查点基因,进行GO功能和KEGG通路富集分析,通过基因共表达分析、筛选与ELTD1相关的基因.结果:与癌旁组织比较,ELTD1在ccRCC组织中呈高表达(P<0.05).TCGA-KIRC队列中,ELTD1的甲基化水平与其表达呈负相关(R=-0.37,P<0.01).ELTD1转录表达在ccRCC患者年龄、T分期、M分期、临床分期及病理分级组间存在显著差异(均P<0.01),且高表达ELTD1与较长的OS和PFS密切相关(HR=0.55、0.63,均P<0.01),ELTD1高表达是ccRCC的独立保护因素.ELTD1表达与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞和嗜中性粒细胞的免疫浸润呈显著负相关(R=-0.16、-0.27、-0.25、-0.31、-0.27,均P<0.01).GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,血管生成及肿瘤相关信号通路在ELTD1高表达表型中显著富集(均P<0.01).ELTD1共表达基因的生存分析提示,其肿瘤抑制作用与共表达网络有关.结论:ELTD1在ccRCC组织中高表达和低甲基化是患者预后良好的指标,且与免疫浸润相关.
文献关键词：
肾透明细胞癌;表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1;甲基化;免疫浸润;预后标志物
中图分类号：
作者姓名：
黄逸婷;王珂;方晨
作者机构：
苏州大学附属第二医院 临床营养科,江苏 苏州 215004;南京医科大学附属苏州医院泌尿外科,江苏 苏州 215004
文献出处：
引用格式：
[1]黄逸婷;王珂;方晨-.基于生物信息学数据分析ELTD1在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基化水平及其临床意义)[J].中国肿瘤生物治疗杂志,2022(12):1115-1124
A类：
ELTD1
B类：
肾透明细胞癌,癌组织,甲基化水平,表皮生长因子,毒素受体,膜结构,结构域,ccRCC,临床病理特征,公共数据库,数据库分析,TIMER2,免疫细胞浸润,相关免疫,免疫检查点基因,通路富集分析,表达分析,癌旁组织,TCGA,KIRC,转录表达,患者年龄,临床分期,病理分级,OS,PFS,独立保护,保护因素,CD4+T,CD8+T,巨噬细胞,嗜中性粒细胞,免疫浸润,血管生成,肿瘤相关,共表达基因,生存分析,肿瘤抑制,共表达网络,预后标志物
AB值：
0.228839
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