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典型文献
茶树C4H基因的克隆及生物信息学分析
文献摘要:
克隆验证茶树肉桂酸-4-羟基化酶(cinnamate 4-hydroxylase,C4H)基因并预测C4H基因的生物学功能.提取茶树新鲜叶片总RNA,利用逆转录-聚合酶链反应克隆出茶树C4H基因,利用生物信息学软件分析C4H基因编码蛋白质的保守结构域、理化性质、亚细胞定位、跨膜域和信号肽、同源性、系统进化等.结果表明:茶树C4H基因包含一个1518 bp的完整开放阅读框(open reading frame,ORF),编码505个氨基酸;保守结构域分析显示,茶树C4H基因编码的蛋白包含一个p450超家族蛋白的结构域(PLN02394),分子量为58.16 kDa,理论等电点为9.29,为亲水性的不稳定蛋白质,定位在内质网,无信号肽,不含有跨膜结构域,以α-螺旋和无规则卷曲为主构成其蛋白二级结构,C4H基因在氨基酸水平与油茶树同源性最高(92%).本研究成功克隆了茶树C4H基因,分析了其生物学功能,为进一步深入研究C4H基因的功能及茶树合成的分子机理奠定了初步的理论基础.
文献关键词:
茶树;C4H基因;生物信息学分析
作者姓名:
汪文俊;刘青山;罗纪军;朱林;吴琼;谢婷;宗凯;余晓峰
作者机构:
黄山市茶产业促进中心 黄山 245499;黄山小罐茶业有限公司 黄山 245000;合肥海关技术中心 合肥 230022
引用格式:
[1]汪文俊;刘青山;罗纪军;朱林;吴琼;谢婷;宗凯;余晓峰-.茶树C4H基因的克隆及生物信息学分析)[J].中国口岸科学技术,2022(11):91-96
A类:
PLN02394
B类:
C4H,生物信息学分析,肉桂酸,羟基化,cinnamate,hydroxylase,生物学功能,鲜叶,逆转录,聚合酶链反应,利用生物,生物信息学软件,基因编码,编码蛋白,保守结构域,亚细胞定位,跨膜域,信号肽,同源性,系统进化,bp,开放阅读框,open,reading,frame,ORF,白包,p450,超家族,分子量,kDa,等电点,亲水性,内质网,跨膜结构域,无规则,卷曲,蛋白二级结构,油茶树,分子机理
AB值:
0.353341
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