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高通量互作蛋白组图谱研究揭示U6 snRNA在肿瘤细胞中多维度调控mRNA加工成熟过程
文献摘要：
目的 采用ChIRP技术纯化肿瘤细胞中内源U6 snRNA(简称U6)互作蛋白,结合高灵敏度液相色谱-质谱联用技术对所获得的互作蛋白组进行鉴定,系统揭示U6参与肿瘤细胞中新的生物学功能和分子调控机制.方法 合成含生物素标记的U6特异性探针,利用分子杂交技术特异捕获经甲醛交联的内源U6与互作蛋白形成的复合物,并结合高灵敏度质谱分析技术鉴定出U6互作蛋白组.利用生物信息分析手段分析U6在肿瘤细胞中的功能.结果 通过严格的筛选本研究最终鉴定到135个特异的内源U6互作蛋白.GO、KEGG、蛋白复合体富集分析和PPI分析显示U6除了与mRNA前体剪接加工等相关蛋白发生相互作用外,还参与了mRNA从产生到转录后调控等一系列生物学过程,包括参与mRNA转录调控、囊泡运输、成熟mRNA的出核转运、mRNA降解、RNA定位、转录后调控等过程.结论 我们的研究在国际上首次系统揭示了肿瘤细胞U6的相互作用蛋白组图谱,通过对该图谱的分析表明U6多维度地参与了mRNA生物学发生的全过程调控,为U6参与肿瘤发生发展的功能和机制研究提供了全新的方向和思路.
文献关键词：
肿瘤;ChIRP-MS;U6 snRNA;剪接
中图分类号：
作者姓名：
杨芝芝;杨兵;田彬;廖建友
作者机构：
中山大学孙逸仙纪念医院医研中心,广州510120
文献出处：
引用格式：
[1]杨芝芝;杨兵;田彬;廖建友-.高通量互作蛋白组图谱研究揭示U6 snRNA在肿瘤细胞中多维度调控mRNA加工成熟过程)[J].岭南现代临床外科,2022(01):42-50
A类：
ChIRP
B类：
互作蛋白,蛋白组,U6,snRNA,肿瘤细胞,多维度调控,成熟过程,高灵敏度,联用技术,生物学功能,分子调控机制,生物素标记,分子杂交,杂交技术,甲醛,交联,复合物,质谱分析技术,技术鉴定,利用生物,生物信息分析,分析手段,选本研究,复合体,富集分析,PPI,剪接,白发,转录后调控,生物学过程,转录调控,囊泡运输,上首,相互作用蛋白,地参,过程调控,肿瘤发生发展
AB值：
0.281874
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