典型文献
非酒精性脂肪肝差异基因的生物信息学分析
文献摘要：
目的:采用生物信息学方法筛选非酒精性脂肪肝(Non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)的差异基因(Differentially expressed genes,DEGs),为临床寻找相关分子标志物提供理论基础.方法:从基因表达数据库(Gene expression omnibus database,GEO)中获取NAFLD相关基因芯片GSE33814,通过GEO2R筛选DEGs,用R语言对DEGs进行基因本(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,通过STRING数据库建立蛋白互作分析(Protein-Protein Interaction,PPI),筛选关键基因.通过NetworkAnalyst数据库构建靶基因-miRNA网络和靶基因-转录因子(Transcription factors,TF)网络.结果:经筛选共获得193个DEGs,主要富集于中性粒细胞的活化及免疫反应等生物功能方面,且参与柠檬酸循环等信号通路.PPI筛选10个关键基因.结论:筛选所得的DEGs可能在NAFLD的发生发展中发挥重要作用,有望成为NAFLD早期筛查、诊断的生物学靶标.
文献关键词：
非酒精性脂肪肝;差异表达基因;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
刘洁;陈树嘉;李嘉
作者机构：
天津医科大学研究生院,天津 300203;天津市第二人民医院肝病科,天津 300192
文献出处：
引用格式：
[1]刘洁;陈树嘉;李嘉-.非酒精性脂肪肝差异基因的生物信息学分析)[J].四川生理科学杂志,2022(08):1317-1321
A类：
GSE33814
B类：
非酒精性脂肪肝,差异基因,生物信息学分析,生物信息学方法,Non,alcoholic,fatty,liver,disease,NAFLD,Differentially,expressed,genes,DEGs,分子标志物,基因表达数据库,expression,omnibus,database,基因芯片,GEO2R,Ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,富集分析,STRING,数据库建立,蛋白互作分析,Protein,Interaction,PPI,选关,关键基因,NetworkAnalyst,数据库构建,靶基因,miRNA,Transcription,factors,TF,共获,免疫反应,生物功能,柠檬酸循环,早期筛查,靶标,差异表达基因
AB值：
0.407167
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