典型文献
宫颈癌组织基因表达谱差异筛选及功能预测
文献摘要：
目的 筛选宫颈癌组织中的差异表达mRNA,并探讨其生物学功能以及参与的信号通路.方法 通过对微阵列数据库GSE63514和GSE55940中的33例宫颈癌患者的宫颈癌组织和癌旁组织基因芯片数据进行生物信息学分析,筛选出差异表达mRNA,并预测其参与的生物学功能和信号通路.结果 宫颈癌组织中,98个mRNA上调,138个mRNA下调;其中CTHRC1、ZIC2、MMP12、AIM2、CA9的表达显著上调,CRNN、CRISP3、TMPRSS11B、SPINK7、MAL的表达显著下调(P<0.05).基因本体论(GO)富集分析结果显示,表达上调的mRNA涉及220个生物学过程,表达下调的mRNA涉及83个生物学过程.京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析显示,上调mRNA显著富集到Cell cycle、DNA replication、Toll-like receptor signaling pathway、Bladder cancer和IL-17 signaling pathway 5条信号通路,下调mRNA显著富集到Arachidonic acid metabolism和Staphylococcus aureus infection 2条信号通路.结论 本研究得到了宫颈癌组织中mRNA表达谱,其中异常表达的mRNA(CTHRC1和CRNN)可能在宫颈癌的生理病理学中发挥关键作用.
文献关键词：
CTHRC1;CRNN;信号转导通路;宫颈癌
中图分类号：
作者姓名：
庞喜侠;刘晓霞
作者机构：
上海市杨浦区控江医院妇科,上海,200093;复旦大学附属妇产科医院妇科,上海,200011
文献出处：
引用格式：
[1]庞喜侠;刘晓霞-.宫颈癌组织基因表达谱差异筛选及功能预测)[J].临床医学研究与实践,2022(34):13-17
A类：
GSE55940,CRISP3,TMPRSS11B,SPINK7
B类：
宫颈癌组织,基因表达谱差异,功能预测,差异表达,生物学功能,微阵列数据,GSE63514,宫颈癌患者,癌旁组织,基因芯片,生物信息学分析,出差,CTHRC1,ZIC2,MMP12,AIM2,CA9,CRNN,MAL,基因本体论,生物学过程,京都基因与基因组百科全书,通路富集分析,Cell,cycle,replication,Toll,like,receptor,signaling,pathway,Bladder,cancer,Arachidonic,acid,metabolism,Staphylococcus,aureus,infection,异常表达,生理病理,信号转导通路
AB值：
0.364262
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