典型文献
基于数据库挖掘分析USH2 A在结直肠腺癌中潜在的预后价值及其与肿瘤突变负荷和抗肿瘤免疫的相关性
文献摘要：
目的 利用TCGA和ICGC数据库,分析USH2A突变在结直肠腺癌患者中潜在的预后价值及其与肿瘤突变负荷(TMB)和抗肿瘤免疫的相关性.方法 通过R语言软件筛选出TCGA和ICGC数据库中结直肠腺癌高频突变基因,分析其与TMB的相关性;使用Kaplan-Meier生存曲线分析高频突变基因的生存差异,利用Cox比例风险回归模型进一步分析结直肠腺癌患者临床特征、TMB、USH2A突变与预后的关系;利用GSEA软件对USH2A进行功能富集分析,探究与USH2A相关的信号通路;利用CIBERSORT法评估肿瘤样本中免疫细胞浸润的占比差异,并分析USH2A与肿瘤免疫细胞浸润的相关性.以P<0.05为差异具有统计学意义.结果 本研究筛选出20个与TMB突变相关的基因;Kaplan-Meier生存分析证实,USH2A突变与结直肠腺癌患者的生存和预后有关,且突变组预后更差(P=0.0009);Cox回归分析显示,USH2A突变可作为影响结直肠腺癌的独立预后因素;GSEA富集分析显示朊病毒病、自然杀伤细胞介导的细胞毒作用途径、免疫球蛋白肠道免疫网络、自身免疫性甲状腺疾病、抗原提呈和处理途径在USH2A突变中出现富集;CIBER-SORT结果表明,USH2A突变组中CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞和激活NK细胞浸润比例更高;矩阵分析显示,CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞和激活NK细胞之间呈正相关.结论 USH2A突变可用于预测结直肠腺癌的预后,且与TMB和抗肿瘤免疫浸润相关,为进一步的治疗提供了潜在靶点.
文献关键词：
结直肠腺癌;USH2A;TMB;肿瘤免疫浸润细胞;预后
中图分类号：
作者姓名：
菅金波;张鲁燕;于泽顺;李保松;宁方玲;王峰
作者机构：
滨州医学院附属医院肿瘤科 山东 滨州 256603;滨州市人民医院肿瘤三科 山东 滨州 256610;滨州医学院附属医院结直肠疝外科 山东 滨州 256603
文献出处：
引用格式：
[1]菅金波;张鲁燕;于泽顺;李保松;宁方玲;王峰-.基于数据库挖掘分析USH2 A在结直肠腺癌中潜在的预后价值及其与肿瘤突变负荷和抗肿瘤免疫的相关性)[J].滨州医学院学报,2022(06):401-408
A类：
USH2,CIBER
B类：
挖掘分析,结直肠腺癌,预后价值,肿瘤突变负荷,抗肿瘤免疫,TCGA,ICGC,USH2A,TMB,高频突变,突变基因,Kaplan,Meier,生存曲线分析,生存差异,Cox,GSEA,功能富集分析,CIBERSORT,肿瘤免疫细胞浸润,变相,生存分析,独立预后因素,朊病毒病,自然杀伤细胞,细胞毒作用,作用途径,免疫球蛋白,肠道免疫,自身免疫性甲状腺疾病,抗原提呈,CD8+T,滤泡,辅助性,NK,浸润比例,矩阵分析,潜在靶点,肿瘤免疫浸润细胞
AB值：
0.21859
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