典型文献
转录组测序分析急、慢性乙型肝炎患者外周血单个核细胞基因变化
文献摘要:
目的 筛选急性乙型肝炎(acute hepatitis B,AHB)和慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)外周血单个核细胞中异常表达基因.方法 收集在右江民族医学院附属医院就诊的3例AHB与3例CHB外周血,分离单个核细胞,提取RNA后进行转录组测序,根据P<0.05且|log2FC|>1计算两组样本的表达差异,绘制差异基因热图.对差异基因进行GO功能与KEGG信号通路聚类.结果 AHB组和CHB组两组间满足P<0.05且|log2FC|>1差异条件的基因共计725个,其中上调372个,下调353个.差异基因主要富集的GO功能:微管发生功能、内源性刺激反应功能、组织发生功能、细胞增殖调控功能与细胞增殖功能和细胞外区域功能.差异基因主要富集的KEGG信号通路:PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、硫胺素代谢通路、癌症转录失调和IL-17信号通路.结论 提供了AHB和CHB外周血单个核细胞中差异表达基因变化的一般情况与可能调控功能和通路,可能有助于阐明AHB和CHB的发展机制.
文献关键词:
乙型肝炎;转录组测序;单个核细胞;差异表达基因
中图分类号:
作者姓名:
钟丽梅;韦武均;黄晶晶;胡仁统;林成;黎作茶;韦家柱;陈晓昊;周律
作者机构:
右江民族医学院附属医院急诊科,广西 百色 533000;右江民族医学院附属医院临床检验诊断研究中心,广西 百色 533000;广西肝胆疾病临床医学研究中心,广西 百色 533000;广西百色市妇幼保健院保健科,广西 百色 533000;右江民族医学院附属医院肿瘤科,广西 百色 533000
文献出处:
引用格式:
[1]钟丽梅;韦武均;黄晶晶;胡仁统;林成;黎作茶;韦家柱;陈晓昊;周律-.转录组测序分析急、慢性乙型肝炎患者外周血单个核细胞基因变化)[J].右江民族医学院学报,2022(06):835-839
A类:
B类:
转录组测序分析,慢性乙型肝炎,乙型肝炎患者,外周血单个核细胞,急性乙型肝炎,acute,hepatitis,AHB,chronic,CHB,异常表达,右江民族医学院,log2FC,表达差异,差异基因,热图,微管,内源性,性刺激,刺激反应,细胞增殖调控,调控功能,胞外区,外区域,区域功能,PI3K,Akt,MAPK,硫胺素,代谢通路,转录失调,差异表达基因,发展机制
AB值:
0.276282
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