典型文献
芫根调节免疫功能的小肠转录组学研究
文献摘要：
目的 利用生物信息学技术初步探索芫根调控肠道免疫功能的分子生物学机制.方法 选择雄性SPF级BALB/c小鼠18只,随机分为3组,每组6只.SC1组小鼠每只每次灌胃芫根提取液150μL,SC2组小鼠每只每次灌胃绞碎芫根原浆悬液150μL,NC组小鼠每只每次灌胃生理盐水150μL,连续7 d每日灌胃一次.分别取每组小鼠小肠组织样品提取RNA,总RNA的质检合格后,进行转录组测序.按GO功能和KEGG信号通路对差异表达基因聚类分析揭示差异表达高度富集的免疫相关通路.从免疫角度分析芫根灌胃小鼠小肠组织的基因表达变化情况.结果 转录组测序共检测到27733条mRNA的表达,SC1组与NC组比较,显著差异表达基因1635个,其中上调差异表达基因1236个,下调差异表达基因399个;SC2组与NC组比较,显著差异表达基因2872个,其中上调差异表达基因2233个,下调差异表达基因639个(P<0.05).按GO功能和KEGG信号通路聚类分析显示差异表达基因在白介素分泌、干扰素反应、T细胞受体信号通路及维生素和脂肪消化吸收等途径的富集度在两个芫根组中均居于前20位(P<0.01),肠黏膜趋化因子CCL20和巨噬细胞极化标志物CD274等免疫蛋白编码基因差异表达显著且同属于上述多个免疫通路.结论 芫根灌胃小鼠小肠的差异表达基因在白介素分泌、干扰素反应、T细胞受体信号通路、营养物质消化吸收等途径高度富集,提示芫根对肠道免疫系统及肠黏膜功能的调节,其中CD274的表达上调和CCL20的表达下调提示诱导M1型巨噬细胞极化和T细胞活化可能是芫根调控免疫和维护肠道正常结构功能的重要途径.
文献关键词：
芫根;免疫;小肠;转录组学;巨噬细胞;T淋巴细胞
中图分类号：
作者姓名：
代泽咏;骆芷寒;王禹蒙;刘延友;肖静;汪宇辉;郭慧玲;江舟
作者机构：
四川大学华西基础医学与法医学院·国家卫生健康委员会时间生物学重点实验室,四川 成都 610041
文献出处：
引用格式：
[1]代泽咏;骆芷寒;王禹蒙;刘延友;肖静;汪宇辉;郭慧玲;江舟-.芫根调节免疫功能的小肠转录组学研究)[J].西部医学,2022(12):1753-1759
A类：
B类：
芫根,调节免疫,小肠,转录组学,组学研究,利用生物,生物信息学技术,初步探索,肠道免疫功能,分子生物学机制,SPF,BALB,SC1,灌胃,提取液,SC2,绞碎,原浆,NC,生理盐水,样品提取,质检,转录组测序,差异表达基因,免疫相关,相关通路,根灌,表达变化,调差,白介素,干扰素,细胞受体,消化吸收,富集度,根组,均居,居于,趋化因子,CCL20,巨噬细胞极化,CD274,免疫蛋白,蛋白编码,编码基因,基因差异表达,同属,营养物质消化,免疫系统,肠黏膜功能,M1,细胞活化,结构功能
AB值：
0.284343
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