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核受体结合SET域蛋白1催化活性区域B细胞优势表位的预测与分析
文献摘要：
目的 预测核受体结合SET域蛋白1催化活性区域(NSD1-CD)B细胞优势表位,并分析其功能.方法 以NSD1-CD的氨基酸序列为基础,利用生物信息学软件,采用Hopp&Woods亲水性方案、Zimmerman极性参数、Jameson-Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案等,进一步运用抗原指数预测,并结合三级结构分析NSD1-CDB细胞优势表位及其功能.结果 NSD1全长为2696个氨基酸,NSD1-CD(1 852～2082)由231个氨基酸组成,相对分子质量为26.53 kDa.经综合分析,NSD1-CDB细胞优势表位可能存在于NSD1全长序列N端的1 865～1 869及1 959～1964区段,优势表位KKPPP(1 865～1 869)距离s-腺苷甲硫氨酸较近,可能与转甲基功能关系紧密.结论 多参数预测NSD1-CD B细胞优势表位可为应用多肽小片段制备单克隆抗体、表位疫苗及研究其蛋白功能提供重要的依据.
文献关键词：
组蛋白赖氨酸甲基化酶;核受体结合SET域蛋白1;B细胞表位
中图分类号：
作者姓名：
陈旭东
作者机构：
315100宁波,宁波大学附属李惠利医院
文献出处：
引用格式：
[1]陈旭东-.核受体结合SET域蛋白1催化活性区域B细胞优势表位的预测与分析)[J].现代实用医学,2022(03):289-292,封2
A类：
Hopp,Emini,KKPPP,组蛋白赖氨酸甲基化酶
B类：
核受体,SET,催化活性,活性区域,NSD1,氨基酸序列,利用生物,生物信息学软件,Woods,亲水性,Zimmerman,Jameson,Wolf,原指,可及性,三级结构,CDB,全长,氨基酸组成,相对分子质量,kDa,区段,腺苷,甲硫氨酸,功能关系,系紧,多参数,参数预测,多肽,小片,单克隆抗体,表位疫苗,蛋白功能,细胞表位
AB值：
0.3347
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