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典型文献
基于分子对接与数据挖掘探讨生姜解半夏毒的相关机制
文献摘要:
目的:基于分子对接与数据挖掘研究生姜解半夏毒的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索生姜有效成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测生姜成分靶点,经Swiss-model同源建模半夏凝集素后进行分子对接.通过DisGeNET数据库获取炎症相关靶点,通过基因映射获取生姜治疗炎症的作用靶点.应用String构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选关键基因.对靶点基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析.结果:筛选得到生姜有效成分5种,与半夏凝集素均有较强结合力.生姜治疗炎症靶点49个,关键靶点有15个,包括MMP9、HSP90AA1、PPARG、RELA、APP、ICAM1、MMP2、mTOR等.通过GO与KEGG富集分析,49个靶点基因涉及急性炎症反应、炎症反应的调节、炎症介质的产生、T细胞的激活、淋巴细胞迁移生物过程,且主要富集于Th17细胞分化相关通路.结论:生姜对半夏毒性成分产生抑制作用并通过减轻炎症反应来发挥解毒作用.
文献关键词:
生姜;半夏;半夏凝集素;毒性;同源建模;分子对接;信号通路;炎症
作者姓名:
李浩然;李维英;吴宏赟;彭伟;周嘉培
作者机构:
山东中医药大学,济南,250014;潍坊市妇幼保健院,潍坊,261011;山东中医药大学附属医院,济南,250014
文献出处:
引用格式:
[1]李浩然;李维英;吴宏赟;彭伟;周嘉培-.基于分子对接与数据挖掘探讨生姜解半夏毒的相关机制)[J].世界中医药,2022(06):767-772
A类:
B类:
分子对接,讨生,生姜,相关机制,系统药理学,分析平台,TCMSP,有效成分,SwissTargetPrediction,model,同源建模,半夏凝集素,DisGeNET,作用靶点,String,靶点蛋白,蛋白质相互作用,PPI,选关,关键基因,对靶,靶点基因,基因本体,富集分析,京都基因和基因组百科全书,选得,结合力,关键靶点,MMP9,HSP90AA1,PPARG,RELA,ICAM1,MMP2,mTOR,急性炎症,炎症介质,细胞迁移,生物过程,Th17,细胞分化,相关通路,毒性成分,解毒作用
AB值:
0.366323
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