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2018-2021年北京地区某医院水痘-带状疱疹病毒分子特征研究
文献摘要：
目的 了解2018-2021年北京地区流行的水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)的基因型别特征,为水痘防控工作提供科学依据.方法 纳入2018-2021年我中心收治的157例水痘病例,检测VZV核酸,对阳性样本的VZV基因组的开放阅读框(open reading frame,ORF)22、ORF38、ORF54和ORF62区进行PCR扩增和测序,通过分析ORF22的6个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)确定病毒分支,评估ORF38(PstI)、ORF54(BglI)和ORF62(SmaI)的限制性酶切位点,确定野生株和疫苗株.结果 157例水痘患者中有91例VZV阳性,其中39例ORF22区测序成功,其与VZVclade2基因型的代表株VOka的6个SNPs完全相同.亲缘关系分析发现,此39株与clade 2代表株均位于同一分支.通过比对ORF22序列发现仅有1条存在A37990G突变.在上述39例样本中ORF38、ORF54和ORF62全部测序成功28例,通过酶切位点分析发现,本研究获得了 28株病毒酶切位点均为PstI+BglI+SmaI+-,与既往我国报道的clade 2基因型野生株相同.结论 2018-2021年北京地区临床发现VZV毒株均为clade 2基因型野生株,未发现疫苗株感染病例.本研究提示加强原有疫苗接种仍可起到有效预防VZV感染的作用.
文献关键词：
水痘-带状疱疹病毒;基因型;野生株;疫苗株
中图分类号：
作者姓名：
杨俊连;刘诗洋;杨欣欣;霍丹丹;黄磊;周娟娟;陈威巍;许文
作者机构：
100039北京,解放军总医院第五医学中心感染病医学部研究所;100039北京,解放军医学院;100039北京,解放军总医院第五医学中心感染性疾病科;233030,蚌埠医学院研究生院
文献出处：
引用格式：
[1]杨俊连;刘诗洋;杨欣欣;霍丹丹;黄磊;周娟娟;陈威巍;许文-.2018-2021年北京地区某医院水痘-带状疱疹病毒分子特征研究)[J].传染病信息,2022(06):544-550
A类：
ORF54,PstI,BglI,SmaI,VZVclade2,VOka,A37990G,PstI+BglI+SmaI+
B类：
北京地区,水痘,带状疱疹病毒,分子特征,varicella,zoster,virus,基因型别,防控工作,阳性样本,开放阅读框,open,reading,frame,ORF38,ORF62,ORF22,单核苷酸多态性,single,nucleotide,polymorphism,限制性,酶切位点,野生株,疫苗株,代表株,SNPs,完全相同,亲缘关系分析,毒株,感染病,疫苗接种
AB值：
0.243403
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