典型文献
遗传性胆红素代谢障碍与胆汁淤积NGS方法的建立及应用
文献摘要:
为快速准确、低成本、高通量地检测我国人群常见的遗传性胆红素代谢障碍及胆汁淤积综合征,选择了10个易感基因的全部外显子及内含子剪切区的SNP/CNV,建立了基于二代测序技术(next generation sequencing,NGS)的靶向捕获测序方法.通过6例已知突变位点的样本对该方法的准确性进行验证,准确率为100%.收集首都医科大学附属北京友谊医院遗传性胆红素代谢障碍及胆汁淤积综合征患者39例进行检测,共检测到58种突变.检测结果与HGMD、ClinVar、OMIM突变数据库比较,未报道的突变通过千人基因组数据集对比并按照哈温平衡检验(HWE_P>0.05)和χ2检验确定新突变19种.检测到的不同突变类型有效地揭示了该类疾病的遗传多样性.NGS方法的建立及应用为临床诊断提供了新的技术手段.
文献关键词:
遗传性胆红素代谢障碍;胆汁淤积;二代测序技术;靶向捕获
中图分类号:
作者姓名:
宋燚;贾思雨;武丽娜;张伟;欧晓娟;黄坚
作者机构:
首都医科大学附属北京友谊医院临床医学研究所,北京 100050;北京大学人民医院麻醉科,北京 100044;首都医科大学附属北京友谊医院肝病中心,北京 100050
文献出处:
引用格式:
[1]宋燚;贾思雨;武丽娜;张伟;欧晓娟;黄坚-.遗传性胆红素代谢障碍与胆汁淤积NGS方法的建立及应用)[J].生物技术进展,2022(04):591-599
A类:
遗传性胆红素代谢障碍
B类:
胆汁淤积,NGS,建立及应用,快速准确,易感基因,外显子,内含子,剪切区,SNP,CNV,二代测序技术,next,generation,sequencing,靶向捕获,突变位点,首都医科大学,北京友谊医院,HGMD,ClinVar,OMIM,变数,数据库比较,变通,基因组数据,HWE,新突变,遗传多样性
AB值:
0.274827
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