目的 构建miRNA-mRNA调控网络,为探索精神分裂症的分子遗传学发病机制研究提供新的思路.方法 于2021年7月在GEO数据库下载精神分裂症外周血miRNA(GSE54578)和死后大脑扣带回mRNA(GSE145554)微阵列数据集,利用GEO2R获取差异表达的miRNA和mRNA,筛选具有靶向mRNA的差异表达miRNA并预测其上游潜在的转录因子;然后,将差异表达miRNA所靶向mRNA与GSE145554数据集所获取的差异表达mRNA取交集基因;最后,对交集基因实施GO和KEGG通路富集分析以揭示它们的生物学功能,构建交集基因PPI网络和miRNA-mRNA调控网络.结果 GSE54578共识别出8个上调且具有靶向mRNA的差异表达miRNA,差异表达miRNA共预测出转录因子10个;GSE145554识别出247个下调的差异表达mRNA,取交集基因后筛选出17个目标mRNA;GO分析显示,目标mRNA主要参与星形胶质细胞的分化与发育等,KEGG通路富集分析显示,目标mRNA主要参与Rap1和Ras信号传导通路等,PPI网络分析显示,mRNA(KRAS和CD28)可能是精神分裂症的关键基因.结论 基于GEO数据库并整合生物信息学不仅能识别精神分裂症的潜在易感基因,并有助于构建精神分裂症miRNA-mRNA调控网络.

精神分裂症;miRNA;mRNA;调控网络;生物信息学;GEO

何梅;游旭;杨云斌;李艳萍;张丽芬;卢自祥;张云桥;龙青;马晓;曾勇

红河州第二人民医院,云南 红河 654300;昆明医科大学第六附属医院,云南 玉溪 653100

四川精神卫生

[1]何梅;游旭;杨云斌;李艳萍;张丽芬;卢自祥;张云桥;龙青;马晓;曾勇-.基于GEO数据库构建精神分裂症miRNA-mRNA调控网络)[J].四川精神卫生,2022(02):120-125

GSE54578,GSE145554

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