典型文献
整合全基因组关联研究和大脑表达数量性状位点探究精神分裂症重要风险基因
文献摘要:
目的:探究精神分裂症表达异常的致病风险基因。方法:选取56 418例精神分裂症患者与78 818名健康对照者的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据和大脑表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTLs),采用基于汇总数据的孟德尔随机化(summary data-based mendelian randomization analysis,SMR)整合分析精神分裂症的重要风险致病基因,并采用精神分裂症患者尸脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元、人诱导多能干细胞(human induced pluripotent stem cell,hiPSC)和全血表达数据集进行差异表达分析,以验证风险基因表达失调情况。结果:基于SMR共发现16个精神分裂症风险基因(
PSMR<5×10
-6),分别为C4A、HLA-C、EMB、SLC9B1、PCDHA7、BTN3A2、KRT8P46、PCDHA8、SFMBT1、PCCB、WBP1L、BTN3A3、MUSTN1、PPM1M、TYW5和SF3B1。差异表达分析结果进一步验证显示,SF3B1在大脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元(
Padjust=5.22×10
-3)和hiPSC(
Padjust=1.41×10
-4)中表达水平均显著下调。WBP1L在hiPSC(
Padjust=1.28×10
-8)和全血(
Padjust=1.17×10
-4)中表达水平均显著上调。TYW5(
Padjust=3.06×10
-6)在hiPSC中表达水平显著上调,PCCB(
Padjust=1.34×10
-4)、BTN3A2(
Padjust=1.48×10
-3)、PPM1M(
Padjust=5.13×10
-6)和PCDHA8(
Padjust=4.31×10
-2)在hiPSC中表达水平显著下调。BTN3A3(
Padjust=2.18×10
-2)在全血中表达水平显著下调。
结论:精神分裂症风险基因SF3B1、TYW5、PCCB、BTN3A2、PPM1M、PCDHA8、WBP1L和BTN3A3异常表达可增加发病风险。
文献关键词:
精神分裂症;数量性状基因座位;全基因组关联研究;易感基因
中图分类号:
作者姓名:
贾婷婷;张程程
作者机构:
四川大学华西医院心理卫生中心,成都610041
文献出处:
引用格式:
[1]贾婷婷;张程程-.整合全基因组关联研究和大脑表达数量性状位点探究精神分裂症重要风险基因)[J].中华精神科杂志,2022(05):399-407
A类:
eQTLs,PSMR,C4A,SLC9B1,PCDHA7,BTN3A2,KRT8P46,PCDHA8,SFMBT1,WBP1L,BTN3A3,PPM1M,TYW5,Padjust,数量性状基因座位
B类:
全基因组关联研究,数量性状位点,探究精神,风险基因,致病风险,精神分裂症患者,genome,wide,association,study,GWAS,expression,quantitative,trait,loci,孟德尔随机化,summary,data,mendelian,randomization,analysis,整合分析,致病基因,背外侧前额叶皮质,锥体神经元,人诱导多能干细胞,human,induced,pluripotent,stem,cell,hiPSC,全血,差异表达分析,调情,10
,HLA,EMB,PCCB,MUSTN1,SF3B1,异常表达,加发,发病风险,易感基因
AB值:
0.194686
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