典型文献
基于生物信息学的精神分裂症核心基因分析
文献摘要：
目的:通过生物信息学方法研究精神分裂症发生的核心基因及参与的信号通路.方法:在GEO数据库下载GSE17612数据集进行分析,该芯片包括28例精神分裂症患者和23名健康对照,组织为前额叶皮质.将筛选出的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)输入DAVID数据库进行基因本体论(GO)分析及京都基因组百科全书(KEGG)富集分析,用Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作分析图,用Cytohubba插件计算10个关键基因.结果:通过筛选后发现1238个DEGs(603个上调基因及625个下调基因).用DAVID进行GO和KEGG分析后发现免疫炎症反应及细胞因子等参与精神分裂症的发病机制.其中,肿瘤坏死因子(TNF)、成纤维细胞生长因子2(FGF2)、Ⅰ型胶原基因(COL1A1)、结缔组织生长因子(CTGF)、核心蛋白聚糖(DCN)、COL1A2、赖氨酰氧化酶(LOX)、转化生长因子β受体Ⅰ(TGFBR1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)及弹性蛋白(ELN)10个关键基因可作为精神分裂症的潜在生物学标记物.结论:免疫炎症反应及细胞因子等过程可能在精神分裂症病理机制中发挥重要作用.
文献关键词：
精神分裂症;前额叶皮质;免疫炎症反应;差异基因;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
徐斐康;张毅;李偲媛;和申;乔颖
作者机构：
200030 上海交通大学医学院附属精神卫生中心
文献出处：
引用格式：
[1]徐斐康;张毅;李偲媛;和申;乔颖-.基于生物信息学的精神分裂症核心基因分析)[J].临床精神医学杂志,2022(05):374-377
A类：
GSE17612
B类：
核心基因,基因分析,生物信息学方法,GEO,下载,精神分裂症患者,前额叶皮质,差异表达基因,differentially,expressed,genes,DEGs,DAVID,基因本体论,京都,百科全书,富集分析,Cytoscape,软件构建,蛋白互作分析,析图,Cytohubba,插件,关键基因,过筛,免疫炎症反应,成纤维细胞生长因子,FGF2,原基,COL1A1,结缔组织生长因子,CTGF,核心蛋白聚糖,DCN,COL1A2,赖氨酰氧化酶,LOX,转化生长因子,TGFBR1,血管内皮生长因子,VEGFA,弹性蛋白,ELN,生物学标记物,精神分裂症病,病理机制,差异基因
AB值：
0.329082
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