典型文献
中国首例境外输入性新冠肺炎病例SARS-CoV-2全基因组序列分析
文献摘要：
目的 分析宁夏发现的中国首例输入性新冠肺炎病例病毒全基因组序列与遗传特性.方法 病例咽拭子标本进行病毒核酸提取和实时荧光RT-PCR检测,通过高通量测序获取病毒全基因组序列;从NCBIGen-Bank数据库和国家生物信息中心(CNCB)获取77条新冠病毒全基因组序列进行基因特征和系统进化分析.结果 根据病例流行病学史,确定其为中国首例境外输入病例,通过高通量测序,获得了感染该病例SARS-CoV-2的全基因组序列(29903 bp),同源性分析表明,该病毒具有3个与国内株均不一致的SNP位点(G11083T、T11244C和T11318C),但为错义突变,不引起抗原变化;系统发育分析表明,该病毒与土耳其、巴基斯坦和缅甸等来源的毒株位列同一分支,处于LineageB.2进化分支,具有较近的亲缘关系,而与国内流行株(处于LineageB.1分支)处于不同的进化支,亲缘关系较远.结论 该病例为中国首例境外输入新冠肺炎感染病例,结合病例流行病学史和病毒基因组特征,证实该病例来源于伊朗,处于LineageB.2进化分支,需加强不同地区境外输入病例监测和病毒全基因组测序.
文献关键词：
基因组;新型冠状病毒;新型冠状病毒肺炎;输入性病例
中图分类号：
作者姓名：
蒯文和;马江涛;刘翔;马学平;曹慜;张银豪;赵建华
作者机构：
宁夏疾病预防控制中心,银川 750004
文献出处：
引用格式：
[1]蒯文和;马江涛;刘翔;马学平;曹慜;张银豪;赵建华-.中国首例境外输入性新冠肺炎病例SARS-CoV-2全基因组序列分析)[J].宁夏医科大学学报,2022(10):984-988
A类：
NCBIGen,CNCB,G11083T,T11244C,T11318C,LineageB
B类：
首例,SARS,CoV,全基因组序列分析,遗传特性,咽拭子,病毒核酸,核酸提取,Bank,信息中心,新冠病毒,基因特征,系统进化分析,流行病学史,境外输入病例,bp,同源性分析,SNP,错义突变,系统发育分析,土耳其,巴基斯坦,缅甸,毒株,位列,进化分支,亲缘关系,内流,较远,感染病,合病,病毒基因组,基因组特征,伊朗,病例监测,全基因组测序,输入性病例
AB值：
0.215594
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