典型文献
与胰腺癌免疫预后相关的自噬相关基因预测
文献摘要：
目的 通过表征自噬相关基因(ARGs)在胰腺癌(PAAD)中的表达模式和预后,寻找与胰腺癌免疫治疗预后不良相关的候选基因.方法 从人类自噬数据库(HADb)和基因集富集分析(GSEA)网站获得566个自噬相关基因,通过GEPIA、Kaplan-Meier Plotter和cBioPortal数据库检测胰腺癌患者中ARGs的RNA-seq表达和生存分析数据,筛选出与无复发生存期(RFS)和总生存期(OS)显著相关的差异表达基因(DEGs).利用DAVID及STRING数据库进行GO和KEGG分析,预测相关信号通路.利用TISIDB分析ARGs的表达量与肿瘤浸润淋巴细胞及免疫检查点抑制剂的相关性.结果 GEPIA分析结果显示大部分DEGs在胰腺癌中表达高于正常胰腺组织(P<0.05).生存分析结果表明CTTN、MET、MTDH、RALB、RIPK2、BCL2L1、CHMP2B、EIF2S1、ITGA3、NCKAP1、SH3GLB1表达高的患者有更低的OS和RFS.ATP6V0D1、ATP6V0A1、ATP6V0E2、MAP1LC3A表达高的患者有更高的OS和RFS.KEGG表明NOD样受体信号通路、PI3K-AKT信号通路和RAS信号通路是预后不良相关基因的主要的信号通路.TISIDB分析表明,候选ARGs与肿瘤浸润淋巴细胞之间的相关性趋势同ARGs与免疫检查点抑制剂之间的趋势存在相似性.结论 自噬相关基因MET、RALB、RIPK2、BCL2L1、ITGA3在胰腺癌中表达升高,是潜在的影响免疫治疗预后不良的候选基因.
文献关键词：
自噬相关基因;胰腺癌;预后价值;免疫检查点抑制剂
中图分类号：
作者姓名：
苏泽莹;刘倩;曾显容;黄婕;陈斯泽
作者机构：
广东药科大学附属第一医院肿瘤科,广东广州510080;广东药科大学附属第一医院广东省食管癌精准治疗工程技术研究中心,广东广州510080;广东药科大学附属第一医院科学研究中心,广东广州510080
文献出处：
引用格式：
[1]苏泽莹;刘倩;曾显容;黄婕;陈斯泽-.与胰腺癌免疫预后相关的自噬相关基因预测)[J].广东药科大学学报,2022(02):90-99
A类：
RALB,CHMP2B,EIF2S1,NCKAP1,SH3GLB1,ATP6V0D1,ATP6V0A1,ATP6V0E2,MAP1LC3A
B类：
胰腺癌,自噬相关基因,征自,ARGs,PAAD,表达模式,免疫治疗,治疗预后,预后不良,良相,候选基因,HADb,基因集富集分析,GSEA,GEPIA,Kaplan,Meier,Plotter,cBioPortal,数据库检测,seq,生存分析,无复发生存期,RFS,总生存期,OS,差异表达基因,DEGs,DAVID,STRING,TISIDB,肿瘤浸润淋巴细胞,免疫检查点抑制剂,胰腺组织,CTTN,MET,MTDH,RIPK2,BCL2L1,ITGA3,NOD,样受体,PI3K,AKT,RAS,预后价值
AB值：
0.275144
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