典型文献
基于TCGA数据库的肝癌生物信息学分析及其预后模型的建立
文献摘要：
目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,筛选肝癌发生发展相关的核心基因,构建肝癌预后风险评估模型.方法 筛选TCGA数据库中肝癌组织与癌旁组织的差异基因进行生物信息学分析,对差异基因进行Kaplan-Meier生存分析、Cox单因素分析并寻找交集基因集,对交集基因集进行Cox多因素分析寻找核心基因并构建核心基因的预后风险评估模型.结果 1836个差异上调基因主要富集于DNA结合转录激活因子活性及DNA结合转录激活因子活性,特异性RNA聚合酶Ⅱ功能上(P﹤0.0001),主要富集于神经活性配体受体相互作用、细胞周期通路上(P﹤0.0001);77个差异下调基因主要富集于糖结合功能上(P﹤0.001).Kaplan-Meier生存分析与Cox单因素分析得到29个交集基因,Cox多因素分析后构建了10个核心基因组成的预后模型,受试者工作特征(ROC)曲线表明预后模型预测肝癌患者预后的价值较高.结论 与肝癌的发生发展相关的10个核心基因组成的预测模型可有效判断肝癌患者预后,指导临床诊疗.
文献关键词：
肝癌;生存分析;预后模型
中图分类号：
作者姓名：
张鑫;冉小柯;赵云霞;陈茜;徐宗瑶;陈晓琦
作者机构：
河南中医药大学第一临床医学院,郑州 450000;河南中医药大学第一附属医院脾胃肝胆科,郑州 4500000
文献出处：
引用格式：
[1]张鑫;冉小柯;赵云霞;陈茜;徐宗瑶;陈晓琦-.基于TCGA数据库的肝癌生物信息学分析及其预后模型的建立)[J].癌症进展,2022(13):1329-1333
A类：
B类：
TCGA,生物信息学分析,预后模型,癌症基因组图谱,核心基因,预后风险,风险评估模型,肝癌组织,癌旁组织,差异基因,Kaplan,Meier,生存分析,Cox,交集,多因素分析,转录激活因子,细胞周期通路,受试者工作特征,肝癌患者,临床诊疗
AB值：
0.197427
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