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典型文献
马尾松树高生长性状显著关联基因挖掘
文献摘要:
全基因组关联分析是获得控制目标性状基因的重要方法.为挖掘马尾松(Pinus massoniana)树高生长性状所在基因序列并了解其基本功能,通过对9个SSR标记的转录组序列进行第2代测序与第3代全长转录组测序,将两者结果进行比对,获得9个位点所在基因的全长转录组序列,并在七大数据库进行基因功能注释.结果表明,9个基因的第2代测序结果与第3代全长转录组测序结果比对一致性平均为99.69%,均具有高度的一致性.经第3代全长转录组测序,9个基因序列平均长度为1706 bp,比第2代测序结果稍短.经过数据库比对,经第3代全长转录组测序,9个基因分别在云杉(Pi?cea asperata)、白云杉(Picea glauca)和油松(Picea tabuliformis)基因组中发现同源基因.8个基因在数据库中获得功能注释,分别属于转录因子、电子传递链参与基因、60S核糖体蛋白大亚基编码基因、ATP酶类编码基因及TCHQD类谷胱甘肽S-转移酶编码基因.研究结论可为马尾松树高生长分子调控机制研究提供重要参考.
文献关键词:
基因组测序;树高;马尾松
作者姓名:
龚桂芳;冯源恒;罗群凤;杨章旗
作者机构:
广西壮族自治区林业科学研究院 广西优良用材林资源培育重点实验室 国家林业和草原局马尾松工程技术研究中心 广西马尾松工程技术研究中心,广西南宁 530002
文献出处:
引用格式:
[1]龚桂芳;冯源恒;罗群凤;杨章旗-.马尾松树高生长性状显著关联基因挖掘)[J].广西林业科学,2022(02):180-183
A类:
cea,TCHQD
B类:
马尾松,松树,树高生长,生长性状,关联基因,基因挖掘,全基因组关联分析,控制目标,目标性,Pinus,massoniana,基因序列,基本功能,SSR,转录组序列,全长转录组测序,个位,大数据库,基因功能注释,结果比对,平均长度,bp,稍短,库比,云杉,asperata,白云,Picea,glauca,油松,tabuliformis,同源基因,电子传递,60S,核糖体蛋白,亚基,编码基因,ATP,酶类,谷胱甘肽,转移酶,分子调控机制,基因组测序
AB值:
0.337181
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