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广西华珊瑚蛇线粒体基因组全序列测定与分析
文献摘要：
本研究对眼镜蛇科广西华珊瑚蛇(Sinomicrurus peinani)线粒体基因组序列进行测定与分析,并探究其与近缘种的系统发育关系.结果表明,广西华珊瑚蛇线粒体基因组是一条全长19 477 bp的环状DNA,基因组碱基构成为A(33.4％)、T(28.1％)、C(26.6％)和G(11.9％).共编码38个基因,包含2个核糖体RNA(rRNA)基因、22个转移RNA(tRNA)基因、13个蛋白质编码基因及1个线粒体基因控制区(D-loop).13个蛋白质编码基因均采用AUG作为起始密码子,UAA和UGA作为终止密码子;蛋白质编码基因编码频率较高的氨基酸分别为亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Ile)、苏氨酸(Thr)和丝氨酸(Ser);相对密码子使用度(RSCU)频率最高的4个密码子依次是CGA、UGA、CUA和CCA.22个tRNA,除tRNASer(一臂两环)外其他均可形成典型三叶草结构.基于眼镜蛇科线粒体基因组系统发育分析结果表明,与广西华珊瑚蛇关系最密切的是中华珊瑚蛇(Sinomicrurus macclellandi),其次是孟加拉眼镜蛇(Naja kaouthia)与眼镜王蛇(Ophiophagus hannah).
文献关键词：
广西华珊瑚蛇;线粒体基因组;序列分析;系统进化
中图分类号：
作者姓名：
周圣博;孟佳瑶;智歆然;周滋航;彭杰;覃再林;关萍
作者机构：
沈阳农业大学生物科学技术学院 沈阳 110866;辽宁省全球变化与生物入侵重点实验室 沈阳 110866;沈阳农业大学动物科学与医学学院 沈阳 110866;沈阳农业大学园艺学院 沈阳 110866
文献出处：
引用格式：
[1]周圣博;孟佳瑶;智歆然;周滋航;彭杰;覃再林;关萍-.广西华珊瑚蛇线粒体基因组全序列测定与分析)[J].动物学杂志,2022(04):481-492
A类：
广西华珊瑚蛇,Sinomicrurus,peinani,macclellandi,Naja,kaouthia,Ophiophagus,hannah
B类：
线粒体基因组,全序列测定,眼镜蛇,基因组序列,近缘种,系统发育关系,全长,bp,碱基,基构,核糖体,rRNA,蛋白质编码基因,控制区,loop,AUG,UAA,UGA,终止密码子,基因编码,码频率,Leu,异亮氨酸,Ile,苏氨酸,Thr,丝氨酸,用度,RSCU,CGA,CUA,CCA,tRNASer,三叶草,系统发育分析,孟加拉,序列分析,系统进化
AB值：
0.282245
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