典型文献
基于小鼠肺组织蛋白质组学预测哮喘发病机制及潜在治疗靶点
文献摘要:
目的 以蛋白质组学分析为基础,联合网络药理学技术,初步预测哮喘发病的生物学机制及其潜在的核心治疗靶点.方法 采用卵清蛋白诱导和激发,建立小鼠哮喘模型;通过Maxquant检索,获得质谱蛋白和基因数据,方差分析和t检验获得差异蛋白,建立差异蛋白聚类分析图谱及靶点集,构建蛋白互作网络图,通过网络可视化分析,预测哮喘发病机制涉及的靶点、信号通路和生物学过程.结果 蛋白质组学检索得到5063个基因,以模型组基因表达/空白组基因表达≥2且P≤0.05、模型组基因表达/空白组基因表达≤1/2且P≤0.05为条件筛选得到的差异基因共904个,聚类分析分为3簇,模型组与空白组比较,上调基因595个,下调基因309个;哮喘发病机制可能涉及调控代谢、FcγR介导的吞噬、白细胞内皮迁移、肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体信号通路、B细胞受体信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路、血管平滑肌收缩和细胞黏附等相关通路;筛选得到的作用靶点包括ITGB3、CYBB、SYK、VWF、ITGB2、MYD88、COMP、VEGFA和FCGR2B;且哮喘病变主要影响信号转导、氧化还原过程、免疫应答、炎症反应、细胞黏附、GTP酶活性正调控、细胞凋亡和细胞外基质形成过程等生物学过程.结论 初步揭示了 9个哮喘潜在的治疗靶点,其中靶点VWF和COMP鲜有报道,哮喘发病机制涉及代谢调控、B细胞信号通路和Fc gamma R介导的吞噬等相关信号通路.
文献关键词:
哮喘模型;蛋白质组学;网络药理;作用靶点
中图分类号:
作者姓名:
支文冰;刘洋;李晔;许宗仁;姜盛楠;周洁;孟雪;张红
作者机构:
陕西省中医药研究院(陕西省中医医院)中药研究所,西安710003;陕西中医药大学药学院,陕西咸阳712046
文献出处:
引用格式:
[1]支文冰;刘洋;李晔;许宗仁;姜盛楠;周洁;孟雪;张红-.基于小鼠肺组织蛋白质组学预测哮喘发病机制及潜在治疗靶点)[J].中国医学科学院学报,2022(06):961-969
A类:
B类:
肺组织,组织蛋白,蛋白质组学,潜在治疗,治疗靶点,组学分析,网络药理学,生物学机制,卵清蛋白,哮喘模型,Maxquant,基因数据,差异蛋白,分析图谱,点集,蛋白互作网络,网络图,网络可视化,生物学过程,条件筛选,选得,差异基因,Fc,吞噬,内皮迁移,肿瘤坏死因子信号通路,Toll,样受体,细胞受体,磷脂酰肌醇,蛋白激酶,血管平滑肌,肌收缩,细胞黏附,相关通路,作用靶点,ITGB3,CYBB,SYK,VWF,ITGB2,MYD88,COMP,VEGFA,FCGR2B,哮喘病,信号转导,氧化还原,还原过程,免疫应答,GTP,正调控,细胞外基质,中靶,代谢调控,细胞信号通路,gamma
AB值:
0.378391
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