典型文献
基于网络药理学和分子对接方法研究右归丸治疗膝骨关节炎的作用机制
文献摘要:
目的 采用网络药理学和分子对接的方法探讨右归丸治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制.方法 通过检索计算机系统生物学实验室(TCMSP)数据库获取右归丸的活性成分,利用TCMSP、SwissTargetPrediction和TargetNet预测活性成分的靶点,并从中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、CTD、DisGeNET和GeneCards数据库检索KOA相关靶点,再与右归丸活性成分靶点取交集,获取右归丸治疗KOA的疗效相关靶点;进而通过DrugBank数据库检索美国食品药品监督管理局(FDA)批准的KOA治疗药物及其靶点,利用Cytoscape构建药物-靶点网络,再以STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI)并进行网络基因的基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,构建中药-活性成分-关键靶点-显著通路-生物过程网络.结果 共获取右归丸组方中9味植物药的活性成分158个,对应490个目标靶点,其中76个靶点为右归丸潜在治疗靶点;在这76个靶点中,有13个与FDA批准的5个治疗KOA的西药的靶点相同;通过蛋白质相互作用(PPI)筛选出18个关键靶点;GO富集分析得到生物学过程1281条、分子功能60条以及细胞组分17条,主要与炎症反应、感染以及氧化应激过程相关;KEGG富集分析得出50条显著富集的通路,主要为IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等,其功能主要涉及免疫系统调控、信号传导、内分泌系统、细胞生长与凋亡等.结论 右归丸可以通过多个化合物作用于多个分子靶点发挥其对KOA的治疗作用,其分子机制主要涉及抑制炎症反应、减弱氧化应激和促进软骨细胞增殖等方面.
文献关键词:
右归丸;膝骨关节炎(KOA);网络药理学;分子对接;作用机制
中图分类号:
作者姓名:
刘小沛;谭从娥;沈霞;王相东;邢文文
作者机构:
陕西中医药大学基础医学院,陕西咸阳 712046
文献出处:
引用格式:
[1]刘小沛;谭从娥;沈霞;王相东;邢文文-.基于网络药理学和分子对接方法研究右归丸治疗膝骨关节炎的作用机制)[J].西安交通大学学报(医学版),2022(03):451-461
A类:
B类:
网络药理学,分子对接,对接方法,右归丸,膝骨关节炎,KOA,索计算,计算机系统,系统生物学,生物学实验,TCMSP,SwissTargetPrediction,TargetNet,整合药理学,药理学研究,研究平台,TCMIP,CTD,DisGeNET,GeneCards,数据库检索,活性成分靶点,交集,DrugBank,美国食品药品监督管理局,FDA,治疗药物,Cytoscape,靶点网络,再以,STRING,数据库构建,蛋白相互作用网络,PPI,基因本体论,京都基因与基因组百科全书,富集分析,关键靶点,生物过程,程网,共获,组方,植物药,标靶点,潜在治疗,治疗靶点,点中,西药,蛋白质相互作用,生物学过程,肿瘤坏死因子信号通路,免疫系统,信号传导,内分泌系统,细胞生长,个化,分子靶点,治疗作用,抑制炎症,弱氧化,软骨细胞
AB值:
0.3291
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