典型文献
栽培金鸡菊EST-SSR分子标记开发与亲缘关系分析
文献摘要：
为了开发适用于栽培金鸡菊的EST-SSR分子标记,采用二代高通量测序技术对剑叶金鸡菊'斯丹泰勒'(Coreopsis lanceolata 'Sterntaler')的叶片进行转录组测序.结果表明:通过转录组测序共得到42958条Unigene,利用MISA软件共检测出个6546个SSR位点,平均分布距离6.36 kb.除单核苷酸外,重复类型以二核苷酸和三核苷酸为主,分别占总数的19.28％和30.13％,二者优势重复单元和占比分别为AG/CT(57.30％)和AAT/ATT(27.94％).通过Primer3软件设计得到4499条引物,在随机筛选的50对引物中成功开发出22对多态性较好的引物,扩增出的166个条带全部具有多态性.通过UPGMA聚类分析,在遗传距离为0.460时可将100个栽培金鸡菊种质划分为7类,其遗传相似系数介于0.5422～1之间,平均为0.7476.金鸡菊组、两色组、歧序组和轮叶组相关的种质可作为金鸡菊远缘杂交育种的材料.本研究为栽培金鸡菊的分类鉴定、杂交育种和绘制指纹图谱提供了理论依据.
文献关键词：
金鸡菊;种质资源;EST-SSR;转录组;亲缘关系
中图分类号：
作者姓名：
孙浩男;李蓉;李明阳;郑妍;刘志杰;张存石;刘冬云;李鹤
作者机构：
河北农业大学园林与旅游学院,河北 保定 071000
文献出处：
引用格式：
[1]孙浩男;李蓉;李明阳;郑妍;刘志杰;张存石;刘冬云;李鹤-.栽培金鸡菊EST-SSR分子标记开发与亲缘关系分析)[J].草地学报,2022(06):1430-1440
A类：
剑叶金鸡菊,Sterntaler
B类：
EST,SSR,分子标记开发,亲缘关系分析,二代高通量测序,高通量测序技术,泰勒,Coreopsis,lanceolata,转录组测序,Unigene,MISA,平均分,kb,单核苷酸,重复类型,AG,AAT,ATT,Primer3,软件设计,引物,多态性,条带,UPGMA,遗传距离,遗传相似系数,远缘杂交,杂交育种,分类鉴定,指纹图谱,种质资源
AB值：
0.31146
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