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海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库的构建及验证
文献摘要：
目的 用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)仪构建海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定数据库,评价自建库鉴定准确性并与国外同类产品进行比较.方法 海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库的构建:收集海南患者标本分离10株类鼻疽伯克霍尔德菌用于建库,以VITEK MS RUO模式进行图谱采集及数据库构建,每株菌平行涂布共12个靶点,得到120张质谱图;分别将10株类鼻疽伯克霍尔德菌经35℃和25℃培养24 h,每株菌每个血平板和巧克力平板分别涂3个靶点,共涂了 120个靶点,每个靶点采集1次,得到120张质谱图.培养48 h,再次进行同样的靶点采集120张图谱.将采集获得240张图谱按标准精选得到优质图谱109张.通过仪器建库参数确认,控制原始波峰数量,筛选特征峰并赋权予权重,调整质量数、谱峰强度在规定范围,经过SARAMIS软件分析生成海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌数据库.数据库验证:收集海南不同地区来源患者类鼻疽伯克霍尔德菌30株及其他伯克霍尔德菌20株,以16SrRAN基因测序为金标准,比较自建数据库与VITEK MS v 4.16数据库鉴定类鼻疽伯克霍尔德菌的准确性及图谱特征.结果 构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库经30株类鼻疽伯克霍尔德菌验证菌株确认,基于自建数据库,种水平鉴定准确率为100.0％(30/30),高于VITEK MS v 4.16数据库准确率56.67％(17/30),差异有统计学意义(x2x=11.08,P＜0.005).结论 构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库质量达到临床常规鉴定应用要求,就海南病原流行株的鉴定准确率优于国外同类产品.
文献关键词：
类鼻疽伯克霍尔德菌;光谱法;质量;基质辅助激光解吸电离;数据库;鉴定
中图分类号：
作者姓名：
陈如寿;钟佳芳;石挺丽;吴吉芳;王婧婧;颜礼完
作者机构：
三亚中心医院(海南省第三人民医院)检验科,海南三亚572000;三亚中心医院(海南省第三人民医院)耳鼻喉科,海南三亚572000;三亚中心医院(海南省第三人民医院)医院感染管理科,海南三亚572000
文献出处：
引用格式：
[1]陈如寿;钟佳芳;石挺丽;吴吉芳;王婧婧;颜礼完-.海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库的构建及验证)[J].广东医学,2022(06):707-711
A类：
16SrRAN
B类：
类鼻疽伯克霍尔德菌,质谱数据库,飞行时间质谱,matrix,assisted,laser,desorption,ionization,flight,mass,spectrometry,MALDI,TOF,自建库,国外同类,同类产品,VITEK,RUO,数据库构建,每株,涂布,质谱图,巧克力,行同,精选,选得,波峰,特征峰,质量数,谱峰,峰强度,SARAMIS,基因测序,金标准,自建数据库,图谱特征,鉴定准确率,x2x,应用要求,光谱法,基质辅助激光解吸电离
AB值：
0.168993
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