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转录组测序分析ZNF 185在食管鳞状细胞癌中的作用机制
文献摘要：
目的 通过转录组测序及生物信息学技术分析ZNF185在食管鳞状细胞癌(食管鳞癌)中的作用机制及其下游信号通路.方法 利用shRNA转染食管鳞癌细胞系Eca-109敲低ZNF185的表达,采用转录组测序技术检测mRNA的表达变化.根据测序数据筛选差异基因,通过GO功能分析和K EGG富集分析对差异基因相关的功能及信号通路进行分析.通过STRING工具分析差异蛋白的相互作用,构建出相关的蛋白互作网络,分析关键节点蛋白.结果 ZNF185干扰组与干扰对照组Eca-109细胞的差异基因共有3859个,其中表达升高的基因有2112个,表达下降的基因有1747个.显著富集的GO项目包括RNA剪接、细胞-基质连接、局部粘附等.KEGG富集分析表明ZNF185可能与HIF-1信号通路、p53信号通路有关,蛋白互作网络分析发现了BMP2、OAS2等关键蛋白.结论 通过转录组测序和生物信息分析筛选出ZNF185参与调控食管鳞癌可能的信号通路,为阐明食管鳞癌的发病机制提供了新的思路.
文献关键词：
食管鳞状细胞癌;ZNF185;转录组测序;信号通路
中图分类号：
作者姓名：
宋乃成;王磊;张彬;李寿康;郑志坤;李劲松
作者机构：
华中科技大学同济医学院附属协和医院 胸外科,武汉 430022;华中科技大学同济医学院附属协和医院 肿瘤科,武汉 430022
文献出处：
引用格式：
[1]宋乃成;王磊;张彬;李寿康;郑志坤;李劲松-.转录组测序分析ZNF 185在食管鳞状细胞癌中的作用机制)[J].华中科技大学学报（医学版）,2022(03):287-293
A类：
ZNF185
B类：
转录组测序分析,食管鳞状细胞癌,生物信息学技术,shRNA,转染,食管鳞癌细胞,细胞系,Eca,敲低,转录组测序技术,表达变化,序数,数据筛选,差异基因,功能分析,富集分析,STRING,差异蛋白,关键节点,剪接,粘附,HIF,p53,蛋白互作网络分析,BMP2,OAS2,关键蛋白,生物信息分析
AB值：
0.22888
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