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湘西地区吕氏泰勒虫的单倍型多样性及种系发育关系分析
文献摘要：
为探究湘西地区吕氏泰勒虫的单倍型多样性及其种系发育关系,以采自于湘西地区的16株羊源吕氏泰勒虫为研究对象,PCR扩增其核糖体18SrRNA、线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cox1)基因序列,并分析其单倍型多态性及种系发育关系.结果表明,湘西地区吕氏泰勒虫核糖体18SrRNA基因序列的长度为384 bp,含9个变异位点、7个单倍型(A1—A7),单倍型多样性Hd为0.775;cox1基因序列的长度为1 092 bp,存在2个变异位点、4个单倍型(B1—B4),单倍型多样性Hd为0.625;在18S rRNA+cox1重组的基因序列中,共含有11个变异位点、10个单倍型(C1—C10),单倍型多样性Hd为0.925;其中,A1、A4、B1、B3、B4、C1、C8与C9均为古老单倍型.系统发育分析结果显示,供试的16株羊源吕氏泰勒虫均处于系统发育树的同一分支上.这说明来自于湘西地区的16株羊源吕氏泰勒虫之间尽管存在一定程度的基因变异现象和单倍型多样性,但它们之间存在共同古老的单倍型,表明其个体之间和单倍型之间均具有较近的亲缘关系,未出现遗传分化.
文献关键词：
吕氏泰勒虫;18SrRNA;cox1基因;基因变异;单倍型多样性;种系发育;湘西地区
中图分类号：
作者姓名：
李中波;侯强红;李晖;舒鸣
作者机构：
怀化职业技术学院,湖南怀化418000;湘西民族职业技术学院,湖南吉首416000
文献出处：
引用格式：
[1]李中波;侯强红;李晖;舒鸣-.湘西地区吕氏泰勒虫的单倍型多样性及种系发育关系分析)[J].河南农业科学,2022(04):130-137
A类：
rRNA+cox1
B类：
湘西地区,吕氏泰勒虫,单倍型多样性,种系发育关系,关系分析,核糖体,18SrRNA,体细胞,细胞色素,亚基,基因序列,多态性,bp,变异位点,A1,A7,Hd,B1,B4,C10,A4,B3,C8,C9,系统发育分析,系统发育树,明来,管存,基因变异,亲缘关系,遗传分化
AB值：
0.189104
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