典型文献
胃癌RN A结合蛋白相关预后模型的建立和验证
文献摘要：
目的:探讨RNA结合蛋白构建的胃癌预后模型并验证其准确性.方法:从癌症基因组图谱(CancerGenome Atlas,TCGA)数据库中下载胃癌的RNA测序数据,并测定正常组织和肿瘤组织中不同表达的RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBPs).并系统地研究及分析这些RBPs的表达和预后价值.结果:共鉴定296个不同表达的RBPs,其中166个表达上调,130个表达下调.7个RBPs(RNASE1、SETD7、BOLL、ADARB1、PPARGC1B、LARP6、MSI2)被鉴定为与预后相关的hub基因.基于以上基因构建的预后模型显示,高风险亚组患者总体生存期(OS)较低风险亚组患者低(P<0.05).在train组中,预后模型的ROC曲线下的面积为0.730,test组中为0.653.列线图和HPA数据库进一步验证了胃癌和正常组织中7个关键RBPs的表达差异.结论:胃癌的RN A结合蛋白相关预后模型显示了良好的预后鉴别能力,它将有助于揭示胃癌的发病机制并提供新的临床诊疗思路.
文献关键词：
胃癌;RN A结合蛋白;总体生存率;预后模型;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
马平川;程光华;戴云海;陶绍能;储昭阳
作者机构：
皖南医学院弋矶山医院核医学科,安徽 芜湖 241000;皖南医学院弋矶山医院超声医学科,安徽 芜湖 241000
文献出处：
引用格式：
[1]马平川;程光华;戴云海;陶绍能;储昭阳-.胃癌RN A结合蛋白相关预后模型的建立和验证)[J].现代肿瘤医学,2022(04):652-659
A类：
CancerGenome,SETD7,ADARB1,PPARGC1B,LARP6
B类：
胃癌,结合蛋白,白相,预后模型,癌症基因组图谱,Atlas,TCGA,下载,序数,正常组织,肿瘤组织,binding,protein,RBPs,预后价值,RNASE1,BOLL,MSI2,hub,总体生存期,OS,低风险,train,test,列线图,HPA,表达差异,鉴别能力,临床诊疗,诊疗思路,总体生存率
AB值：
0.315455
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