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灰飞虱G蛋白偶联受体基因的鉴定与分析
文献摘要：
[目的]利用灰飞虱(Laodelphax striatellus)基因组和转录组数据鉴定灰飞虱G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)基因.[方法]构建灰飞虱基因组和转录组本地数据库,以黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)和豌豆蚜(Acyrthosiphon pisum)的GPCR基因为参照序列进行本地BLAST,去除冗余和不含多跨膜螺旋结构的序列后获得灰飞虱GPCR基因;利用NCBI CD-Search对灰飞虱GPCR序列进行跨膜结构域分析;利用Clustal W进行序列比对,并用MEGA 6软件构建灰飞虱GPCR系统发育树.[结果]鉴定了114个灰飞虱GPCR基因,它们分属于A、B、C和D这4个家族.灰飞虱A家族的GPCR数量最多,尤其是其中的神经肽和蛋白激素受体亚家族的基因数量达55个.与黑腹果蝇的GPCR相比,灰飞虱GPCR不仅种类丰富,而且有基因重复和可能的缺失现象.[结论]灰飞虱具有较为全面的GPCR系统,本研究完善了灰飞虱GPCR基因的信息,为进一步研究灰飞虱GPCR的功能奠定了基础.
文献关键词：
灰飞虱;G蛋白偶联受体;基因家族;特征基序;基因重复与缺失
中图分类号：
作者姓名：
徐圣;张怡萍;韩召军;吴敏
作者机构：
南京农业大学植物保护学院,江苏 南京210095
文献出处：
引用格式：
[1]徐圣;张怡萍;韩召军;吴敏-.灰飞虱G蛋白偶联受体基因的鉴定与分析)[J].南京农业大学学报,2022(04):699-710
A类：
基因重复与缺失
B类：
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AB值：
0.346642
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