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典型文献
miR-210-3p在骨质疏松性骨折中靶基因预测及信号通路的生物信息学分析
文献摘要:
目的 通过生物信息学分析人miR-210-3p染色体定位、物种保守性、碱基序列,并分析其调控骨质疏松性骨折的靶基因及分子功能.方法 通过NCBI、PubMed、UCSC等数据库查找miR-210-3p物种保守性和碱基序列,借助TargetScan、miRDB、miRTarBase、GeneCards预测miR-210-3p调控骨质疏松性骨折作用靶点,借助STRING在线数据库和Cytoscape 3.7.0本地软件构建PPI网络图,通过DAVID在线数据库对靶基因进行GO、KEGG富集性分析.结果 已知的成熟miR-210-3p序列在多个物种间具有高度保守性.PPI网络分析显示,miR-210-3p的靶点之间具有非常复杂的作用网络,尤其是靶基因BDNF、TWIST1、MEF2D、MEF2A的编码蛋白在调控骨质疏松性骨折中起关键作用.GO分析发现其靶基因参与骨骼系统发育、骨化、成骨细胞分化等生物学过程.结论 分析结果初步提示miR-210-3p通过调控靶基因广泛参与多种重要的生物学过程,为深入研究miR-210-3p参与抗骨质疏松性骨折机制提供了新的思路与线索.
文献关键词:
骨质疏松性骨折;miR-210-3p;靶基因;信号通路;生物信息学
作者姓名:
张逢乐;杨辉
作者机构:
广州市荔湾区中医医院,广东 广州 510000
文献出处:
引用格式:
[1]张逢乐;杨辉-.miR-210-3p在骨质疏松性骨折中靶基因预测及信号通路的生物信息学分析)[J].基层医学论坛,2022(10):17-20
A类:
B类:
3p,骨质疏松性骨折,折中,中靶,靶基因预测,生物信息学分析,染色体定位,保守性,碱基序列,NCBI,UCSC,TargetScan,miRDB,miRTarBase,GeneCards,作用靶点,STRING,Cytoscape,软件构建,PPI,网络图,DAVID,对靶,种间,非常复杂,BDNF,TWIST1,MEF2D,MEF2A,编码蛋白,骨骼系统,系统发育,骨化,成骨细胞分化,生物学过程,调控靶基因,抗骨质疏松
AB值:
0.30678
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