典型文献
骨质疏松患者基因多态性与椎间盘退变的相关性研究
文献摘要：
目的 探讨分析骨质疏松患者基因多态性与椎间盘退变的相关性研究.方法 通过GEO数据库获取骨质疏松症(osteoporosis,OP)与椎间盘退变(intervertebral disc degenerative,IDD)的基因表达谱数据,分析两者的差异基因并取交集,再利用Cytoscape软件构建PPI网络,根据度值筛选出关键基因,并分析其与OP和IDD之间的关系.最后利用DAVID数据库分析关键基因在OP和IDD发生发展过程中的主要生物功能和信号通路.结果 在OP与IDD的发生发展中共有205个交集基因,其中UBC、YWHAZ、TP53、CUL3、NTRK1、BRCA1、Mcm2、ESR1为关键基因.GO功能分析与KEGG富集分析结果显示,与OP和IDD的发生发展过程密切相关的生物学过程主要涉及蛋白质-DNA复合物组合、蛋白质-DNA复合物亚基组织、蛋白质去泛素化、蛋白质小分子修饰、染色体组织的调控等,主要涉及PI3K/Akt信号通路、泛素介导的蛋白质水解、线粒体自噬、影响细胞周期及凋亡相关通路、神经营养素信号通路、甲状腺激素信号通路等.结论 OP与IDD之间存在着高度重合的差异基因表达,所涉及的基因功能和信号通路有助于了解两种疾病共同的发病机制,并为药物研发及治疗方式提供一定的参考.
文献关键词：
骨质疏松症;椎间盘退变;生物信息学;基因芯片;高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
章晓云;李华南;陈锋;柴源;甘斌;李松
作者机构：
江西中医药大学,江西 南昌330004;广西中医药大学,广西 南宁530000
文献出处：
引用格式：
[1]章晓云;李华南;陈锋;柴源;甘斌;李松-.骨质疏松患者基因多态性与椎间盘退变的相关性研究)[J].中国骨质疏松杂志,2022(03):412-419
A类：
Mcm2
B类：
基因多态性,椎间盘退变,探讨分析,GEO,取骨,骨质疏松症,osteoporosis,OP,intervertebral,disc,degenerative,IDD,基因表达谱,谱数据,交集,Cytoscape,软件构建,PPI,关键基因,DAVID,数据库分析,生物功能,UBC,YWHAZ,TP53,CUL3,NTRK1,BRCA1,ESR1,功能分析,富集分析,生物学过程,复合物,亚基,基组,去泛素化,小分子,分子修饰,PI3K,Akt,蛋白质水解,线粒体自噬,细胞周期,相关通路,神经营养素,甲状腺激素信号通路,差异基因表达,基因功能,药物研发,基因芯片
AB值：
0.354675
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