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基于各向异性网络模型研究δ阿片受体的动力学与关键残基
文献摘要：
目的 阿片受体是一种G蛋白偶联受体(GPCR),主要通过变构转导胞外区内源性配体结合信号,使其与胞内区效应蛋白偶联来介导镇痛反应.δ阿片受体(DOP)除了与疼痛控制有关外,还与情绪控制有关,是一个很有吸引力的治疗靶点.本文旨在分析DOP的结构动力学和变构效应.方法 首先利用各向异性网络模型(anisotropic network model,ANM)对DOP进行建模,通过慢运动模式和快运动模式残基涨落探索DOP的结构动力学与功能的关系.然后,结合微扰响应扫描(perturbation-response scanning,PRS)对DOP中与变构通信相关的关键残基进行识别.结果 慢运动模式可以很好地识别DOP的结构以及功能性钠离子结合位点,快运动模式可以识别出对蛋白质结构稳定起重要作用的关键残基.残基运动相关性分析发现胞外/胞内的跨膜螺旋与环状区域之间存在正相关性,这些区域相互作用促进DOP与配体的结合.PRS分析中敏感性高和效应性高的关键残基在DOP的变构通信中发挥重要作用.结论 这项工作有助于加强对δ阿片受体变构通讯机制的理解,并为药物设计提供有价值的信息.
文献关键词：
δ阿片受体(DOP);各向异性网络模型;微扰响应扫描;动力学;变构机制
中图分类号：
作者姓名：
陈磊;巩卫康;李春华
作者机构：
北京工业大学环境与生命学部,北京100124
文献出处：
引用格式：
[1]陈磊;巩卫康;李春华-.基于各向异性网络模型研究δ阿片受体的动力学与关键残基)[J].生物化学与生物物理进展,2022(06):1146-1154
A类：
各向异性网络模型,ANM,微扰响应扫描,变构机制
B类：
阿片受体,关键残基,偶联,GPCR,转导,胞外区,内源性配体,内区,效应蛋白,镇痛,DOP,疼痛控制,关外,情绪控制,有吸引力,治疗靶点,结构动力学,构效,anisotropic,network,model,过慢,运动模式,快运,涨落,perturbation,response,scanning,PRS,钠离子,离子结合,结合位点,蛋白质结构,结构稳定,药物设计
AB值：
0.278561
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